LSD1抑制剂TAS1440通过转录重编程破坏INSM1-LSD1复合物激活神经内分泌SCLC抑瘤通路

该数据集来自NCBI GEO,聚焦小细胞肺癌(SCLC)中LSD1抑制剂TAS1440的作用机制。数据通过高通量测序进行基因组结合/占据谱分析,涉及人类样本(9606)与平台GPL24676,包含1个文件GSE272003_series_matrix.txt.gz

geo
浏览 6
时间序列分类GPL246769606
GSE272003: LSD1 inhibitor, TAS1440, disrupts INSM1-LSD1 complex activating tumor-suppressive pathways via transcriptional reprogramming in neuroendocrine SCLC

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

LSD1抑制剂TAS1440通过转录重编程破坏INSM1-LSD1复合物激活神经内分泌SCLC抑瘤通路

LSD1 inhibitor, TAS1440, disrupts INSM1-LSD1 complex activating tumor-suppressive pathways via transcriptional reprogramming in neuroendocrine SCLC

该数据集来自NCBI GEO,聚焦小细胞肺癌(SCLC)中LSD1抑制剂TAS1440的作用机制。数据通过高通量测序进行基因组结合/占据谱分析,涉及人类样本(9606)与平台GPL24676,包含1个文件GSE272003_series_matrix.txt.gz。可用于研究TAS1440破坏INSM1-LSD1复合物、抑制LSD1活性并激活NOTCH/TGF-β等抑瘤通路、诱导神经内分泌SCLC细胞分化与增殖抑制的转录调控机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jul 11 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):小细胞肺癌(SCLC)具有侵袭性且治疗选择有限,需要新的疗法。赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1A(LSD1)通过抑制NOTCH/TGF-β信号维持神经内分泌状态;这些信号的重新激活可抑制增殖并诱导分化。然而,LSD1抑制的机制及化疗耐药性仍不清楚。在此,我们利用基于结构的工程化改造开发了TAS1440,一种组蛋白H3竞争性LSD1抑制剂,以提高特异性并减少脱靶效应。与靶向黄素腺嘌呤二核苷酸位点的不可逆抑制剂不同,TAS1440以非共价方式靶向H3结合口袋,从而提高安全性和疗效。TAS1440抑制INSM1/ASCL1高表达的SCLC-A细胞增殖,并在异种移植瘤中诱导肿瘤消退。TAS1440通过双重机制发挥作用:抑制LSD1活性并破坏LSD1抑制性复合物,r

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272003

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 21 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272003

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小细胞肺癌(SCLC)具有侵袭性,治疗选择有限,亟需新的疗法。赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1A(LSD1)通过抑制NOTCH/TGF-β信号通路维持神经内分泌状态;这些信号通路的重新激活可抑制增殖并诱导分化。然而,LSD1抑制的机制及化疗耐药机制仍不清楚。在此,我们利用基于结构的工程化设计开发了TAS1440,一种组蛋白H3竞争性LSD1抑制剂,以提高特异性并减少脱靶效应。与靶向黄素腺嘌呤二核苷酸位点的不可逆抑制剂不同,TAS1440以非共价方式靶向H3结合口袋,从而增强安全性和疗效。TAS1440抑制INSM1/ASCL1高表达的SCLC-A细胞增殖,并在异种移植瘤中诱导肿瘤消退。TAS1440通过双重机制发挥作用:抑制LSD1活性并破坏LSD1抑制性复合物,重塑组蛋白修饰并激活转录因子INSM1和SMAD2。这些作用重编程了肿瘤抑制性的TGF-β/NOTCH信号通路,支持TAS1440作为SCLC的表观遗传疗法。

LSD1酶活性的丧失或INSM1的敲除消除了TAS1440的效果,明确了其作用模式和化疗耐药性。这些发现支持TAS1440作为针对INSM1高表达SCLC-A的下一代表观遗传治疗候选药物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案