GSE270148:髓系祖细胞失调驱动肿瘤免疫抑制巨噬细胞
该数据集来自 NCBI GEO(GSE270148),包含小鼠及肺癌患者的髓系祖细胞、循环单核细胞和肿瘤浸润单核细胞来源巨噬细胞的配对转录组与染色质可及性数据,用于识别驱动促肿瘤巨噬细胞的髓系祖细胞程序

基本信息
资源简介
GSE270148:髓系祖细胞失调驱动肿瘤免疫抑制巨噬细胞
Myeloid progenitor dysregulation fuels immunosuppressive macrophages in tumours
该数据集来自 NCBI GEO(GSE270148),包含小鼠及肺癌患者的髓系祖细胞、循环单核细胞和肿瘤浸润单核细胞来源巨噬细胞的配对转录组与染色质可及性数据,用于识别驱动促肿瘤巨噬细胞的髓系祖细胞程序。数据可用于研究肺癌中 NRF2 介导的氧化应激反应、髓系生成增强及免疫抑制表型的调控机制,支持髓系细胞状态分类与调控程序分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 18 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):单核细胞来源巨噬细胞(mo-macs)常驱动肿瘤微环境(TME)中的免疫抑制,而骨髓中肿瘤增强的髓系生成则为这些细胞群体提供来源。本研究对小鼠和肺癌患者的髓系祖细胞、循环单核细胞及肿瘤浸润 mo-macs 连续群体进行了配对转录组和染色质可及性分析,以识别驱动促肿瘤 mo-macs 的髓系祖细胞程序。我们发现,肺部肿瘤在骨髓髓系祖细胞中启动 Nfe2l2(NRF2)的可及性,作为对氧化应激的细胞保护反应,增强髓系生成的同时抑制干扰素反应并促进免疫抑制。在 TME 中单核细胞分化为 mo-macs 的过程中,NRF2 活性被放大,以调节应激并驱动免疫抑制表型。NRF2 基因缺失和药理学抑制
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE270148
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 28 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
单核细胞衍生的巨噬细胞(mo-macs)常驱动肿瘤微环境(TME)中的免疫抑制,而肿瘤增强的骨髓髓系生成则为这些细胞群体提供来源。本研究对小鼠及肺癌患者的髓系祖细胞、循环单核细胞和肿瘤浸润mo-macs连续群体进行了配对的转录组和染色质可及性分析,以鉴定为促肿瘤mo-macs提供支持的髓系祖细胞程序。我们发现,肺部肿瘤在骨髓髓系祖细胞中启动Nfe2l2(NRF2)的可及性,作为对氧化应激的细胞保护反应,增强髓系生成的同时抑制干扰素反应并促进免疫抑制。在TME中单核细胞向mo-macs分化过程中,NRF2活性被放大,以调节应激并驱动免疫抑制表型。NRF2基因缺失和药理学抑制显著降低了TME中mo-macs的存活和免疫抑制功能,恢复了自然杀伤细胞和T细胞的抗肿瘤免疫,并增强了检查点阻断的疗效。
我们的研究结果确定了一个可靶向的表观遗传节点,该节点调控髓系祖细胞失调,并在肺肿瘤微环境中维持免疫调节性单核细胞来源巨噬细胞,同时强调了早期干预重编程巨噬细胞命运以改善免疫治疗结局的潜力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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