髓系祖细胞失调驱动肿瘤免疫抑制性巨噬细胞数据集2

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE270127

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单核细胞来源的巨噬细胞（mo-macs）驱动肿瘤微环境（TME）中的免疫抑制，而肿瘤增强的骨髓（BM）髓系生成则为这些细胞群体提供来源。在此，我们对小鼠和肺癌患者的BM髓系祖细胞、循环单核细胞和肿瘤浸润mo-macs连续体进行了配对转录组和染色质分析，以鉴定为促肿瘤mo-macs提供支持的髓系祖细胞程序。通过分析染色质可及性和组蛋白修饰变化，我们发现肺部肿瘤在BM髓系祖细胞中为Nfe2l2（NRF2）启动可及性，作为对氧化应激的细胞保护反应。NRF2活性在单核细胞于肺部TME中分化为mo-macs的过程中得以维持并增强，从而调控氧化应激，进而促进代谢适应、抵抗细胞死亡，并促成免疫抑制表型。NRF2基因缺失和药理学抑制显著降低了TME中mo-macs的存活和免疫抑制功能，使NK和T细胞治疗性抗肿瘤免疫得以实现，并与检查点阻断策略产生协同作用。

总之，我们的研究确定了一个可靶向的表观遗传节点，该节点调控髓系祖细胞失调，从而在肿瘤微环境中维持免疫调节型单核细胞衍生的巨噬细胞。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。