Ddx21突变肽作为预防性肺癌疫苗强效新抗原及长期免疫激活研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE270091

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

预防性疫苗是肿瘤预防的重要手段。我们前期的研究表明，将肺癌小鼠原代培养获得的肺癌细胞系KPL160302S和KPL160424S制备成预防性疫苗，接种KPL160302S后肺癌小鼠的生存期显著延长，小鼠的抗肿瘤免疫力增强，CD8+CD4+T细胞数量显著增加，而KPL160424S未能延长生存期，对免疫系统的影响有限。为探究这一差异的原因，通过生物信息学方法筛选出两个突变肽Ddx21和Zfp760作为潜在的新抗原。结果表明，Ddx21MT免疫可显著上调中枢记忆T细胞（TCM），激活小鼠的长期免疫功能。通过转录组测序对加强免疫后磁珠分选的脾脏CD4+和CD8+T细胞进行检测，以探究其差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。