LKB1缺陷NSCLC细胞对高剂量AA诱导焦亡易感
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE269742_series_matrix.txt.gz),针对LKB1缺陷或完整的NSCLC细胞,在有或无高剂量抗坏血酸(AA)预处理条件下进行RNA测序,以分析不同形式程序性细胞死亡信号基因的表达

基本信息
资源简介
LKB1缺陷NSCLC细胞对高剂量AA诱导焦亡易感
LKB1-deficient NSCLC cells show vulnerability to high-dose AA-induced pyroptosis.
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE269742_series_matrix.txt.gz),针对LKB1缺陷或完整的NSCLC细胞,在有或无高剂量抗坏血酸(AA)预处理条件下进行RNA测序,以分析不同形式程序性细胞死亡信号基因的表达。数据可用于研究LKB1缺陷肺癌细胞对高剂量AA诱导焦亡的易感性及炎症性程序性细胞死亡相关信号通路(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jun 13 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):肿瘤细胞中LKB1的缺陷会损害其适当感知代谢应激的能力,最终导致氧化还原失衡。LKB1缺陷的NSCLC细胞主要摄取抗坏血酸。炎症性程序性细胞死亡(PCD),包括坏死性凋亡、焦亡和PANoptosis,可释放炎症介质并改变肿瘤免疫微环境(TIME)的炎症状态。先前研究表明,高剂量AA可促进肺癌细胞死亡,但细胞死亡的方式仍不清楚。为进一步研究上述炎症性PCD的精确方式,我们对LKB1缺陷或完整的细胞在有或无高剂量AA预处理的条件下进行了RNA测序,然后分析了已建立的不同形式程序性细胞死亡信号基因。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE269742
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 20 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
肿瘤细胞中LKB1的缺失会损害其适当感知代谢应激的能力,最终导致氧化还原失衡。LKB1缺陷型NSCLC细胞主要摄取抗坏血酸。炎症性PCD,包括坏死性凋亡、焦亡和PANoptosis,可释放炎症介质并改变TIME的炎症状态。既往研究表明,高剂量AA可促进肺癌细胞死亡,但细胞死亡的方式仍不明确。为进一步探究上述炎症性PCD的精确方式,我们对LKB1缺陷或完整的细胞(经或未经高剂量AA预处理)进行了RNA测序,然后分析了已建立的不同形式程序性细胞死亡信号基因。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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