缺氧驱动HIF2依赖的可逆巨噬细胞细胞周期进入

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE269699

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数据说明

巨噬细胞在健康与疾病中均发挥关键作用。低氧条件（缺氧）主要与分裂细胞的细胞周期阻滞相关。巨噬细胞通常处于G0期静息状态，尽管卵黄囊和骨髓来源的巨噬细胞频繁增殖，且单核细胞衍生的组织巨噬细胞能够响应组织信号而增殖。本研究表明，缺氧（1%氧张力）导致人单核细胞衍生巨噬细胞（MDM）和小鼠腹腔巨噬细胞可逆性进入细胞周期。细胞周期进程主要局限于G1/S期，很少进展至G2/M期。机制上，这种细胞周期转换由HIF2A引导的转录程序触发。该反应伴随细胞周期相关蛋白（包括CDK1）表达增加，以及经典促分裂原活化MEK-ERK增殖通路的可逆性激活。缺氧巨噬细胞中CDK1相关的SAMHD1在T592位点磷酸化，使其对慢病毒转导高度敏感。

此外，激活HIFs的PHD抑制剂能够在巨噬细胞中重现HIF2A依赖性的细胞周期进入，以及对慢病毒转导的易感性。最后，我们证明肺癌中的肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在单细胞水平上表现出代表对低氧和细胞周期进程响应的转录组谱。这项工作揭示了在低氧条件下由HIF2A驱动的巨噬细胞细胞周期进程，最终导致SAMHD1磷酸化和对慢病毒转导的高易感性。这些发现对炎症和肿瘤进展/转移（低氧环境在这些过程中很常见）具有额外的意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。