小鼠中性粒细胞区室架构

数据集包含1个文件,样例为GSE266680_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台GPL16791及物种9606

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基因组GPL167919606
GSE266680: Architecture of the neutrophil compartment in mice

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

小鼠中性粒细胞区室架构

GSE266680 是一个以小鼠中性粒细胞区室结构为主题的基因表达谱数据集,英文标题为 Architecture of the neutrophil compartment in mice,来源为 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov)。该数据集在本站归入肿瘤 / 肺癌分类,包含 1 个数据文件,样例文件名为 GSE266680_series_matrix.txt.gz。其主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台 GPL16791 及物种编号 9606,作者为 Andrés、Hidalgo,发布时间为 May 06 202。数据集以 SuperSeries 形式组织,源站描述指出其由下列 SubSeries 组成。整体而言,该数据集面向中性粒细胞群体组成与表达特征的研究,可供需要该主题表达谱数据的用户下载与二次分析。

【数据集背景】

该数据集聚焦小鼠中性粒细胞区室的结构(Architecture of the neutrophil compartment in mice),属于表达谱研究范畴。中性粒细胞是免疫系统中数量丰富的细胞群体,对其区室组成与转录特征的系统刻画有助于理解相关生物学过程。数据集以 SuperSeries 形式发布,源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,表明其组织方式是将若干子系列汇总为一个总体系列。本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类,主题标签中包含高通量测序表达谱分析(Expression profiling by high throughput sequencing),说明数据通过高通量测序手段获取表达谱信息。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件为 GSE266680_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。主题标签涉及平台 GPL16791 与物种编号 9606。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成,未提供各子系列的具体名称、样本数量、分组设计或基因层面的详细信息。数据的具体字段构成、样本注释内容以及表达量矩阵的维度等,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Andrés、Hidalgo,发布时间为 May 06 202。数据集以 SuperSeries 形式组织,源站描述指出其由下列 SubSeries 组成。关于样本采集的具体组织来源、实验处理条件、测序平台运行参数及数据处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕小鼠中性粒细胞区室结构开展的表达谱分析,例如对中性粒细胞群体转录特征的考察、高通量测序表达数据的整合与比较研究,以及作为相关主题研究的公共数据资源。由于本站分类为肿瘤 / 肺癌,也可能被用于与该分类相关的探索性分析。具体适用的分析类型与研究方向需结合数据实际内容判断,源站未提供针对适用场景的进一步说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE266680_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段解析或编码问题导致后续分析偏差。由于数据集以 SuperSeries 形式组织并包含 SubSeries,使用前宜确认所关注的数据层级。关于读取工具、预处理步骤与标准化方法,源站未提供具体指引。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,样例为系列矩阵文件,源站描述较为简略,仅说明 SuperSeries 由下列 SubSeries 组成。样本量、重复设置、测序深度、数据完整性及质控指标等信息源站未提供,因此在未核对数据内容前不宜对其质量作具体判断。使用时应注意 SuperSeries 与 SubSeries 之间的层级关系,并结合实际字段核对结果评估数据适用性。

【引用与许可】

作者为 Andrés、Hidalgo,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 May 06 202。关于该数据集的引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE266680

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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