靶向DDX3X通过破坏抗氧化稳态和诱导铁死亡抑制KRAS驱动肺癌进展
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,聚焦KRAS驱动肺癌中DDX3X的作用机制。研究显示DDX3X缺失可延缓多种KRAS驱动肺癌模型进展,其抑制通过下调CBS破坏半胱氨酸和谷胱甘肽代谢,诱导肺癌细胞铁死亡,并涉及DDX3X与转录因子JUND结合调控METTL16转录

基本信息
资源简介
靶向DDX3X通过破坏抗氧化稳态和诱导铁死亡抑制KRAS驱动肺癌进展
Targeting DDX3X suppresses progression of KRAS-driven lung cancer by disrupting antioxidative homeostasis and inducing ferroptosis
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,聚焦KRAS驱动肺癌中DDX3X的作用机制。研究显示DDX3X缺失可延缓多种KRAS驱动肺癌模型进展,其抑制通过下调CBS破坏半胱氨酸和谷胱甘肽代谢,诱导肺癌细胞铁死亡,并涉及DDX3X与转录因子JUND结合调控METTL16转录。数据可用于分析DDX3X相关基因表达变化及铁死亡通路研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):约30%的人类癌症携带多种RAS突变,包括KRAS、NRAS和HRAS。在这些突变中,KRAS是肺癌中最常见的亚型。虽然已开发出几种特异性靶向KRASG12C的小分子抑制剂并进行了临床测试,但由于预期会出现耐药性,仍需替代方法。在本研究中,我们提供证据表明,DDX3X的缺失显著延缓了多种KRAS驱动肺癌模型中的肿瘤进展。抑制DDX3X会破坏半胱氨酸和谷胱甘肽代谢,从而诱导肺癌细胞铁死亡。这一效应主要由胱硫醚-β-合酶(CBS,半胱氨酸生成中的限速酶)的下调所介导。在机制上,DDX3X直接结合转录因子JUND,后者介导METTL16的转录调控,一种
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262680
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 06 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262680
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
约30%的人类癌症携带多种RAS突变,包括KRAS、NRAS和HRAS。在这些突变中,KRAS是肺癌中检测到的最常见亚型。尽管已开发出几种特异性靶向KRASG12C的小分子抑制剂并进行了临床测试,但由于预期会出现耐药性,仍需替代方法。在本研究中,我们提供证据表明,DDX3X的缺失显著延缓了多种KRAS驱动的肺癌模型中的肿瘤进展。抑制DDX3X会破坏半胱氨酸和谷胱甘肽代谢,从而诱导肺癌细胞发生铁死亡。这一效应主要由胱硫醚-β-合酶(CBS)的下调所介导,CBS是半胱氨酸生成中的限速酶。在机制上,DDX3X直接结合转录因子JUND,后者介导对METTL16的转录调控,METTL16是一种关键的N6-甲基腺苷甲基转移酶,随后调控CBS转录本的m6A修饰和翻译。
这一级联反应诱导CBS的高甲基化和高表达,进而触发半胱氨酸生成并维持抗氧化稳态,而这对KRAS驱动的肺癌细胞的存活至关重要。最后,我们证明,与DDX3X小分子抑制剂RK-33相比,新开发的DDX3X PROTAC降解剂J10具有多重优势,能有效延缓肺癌进展且副作用有限。这些发现揭示了DDX3X作为辅助治疗KRAS驱动肺癌的有价值靶点的潜力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




