新型LAIR1拮抗剂联合抗PD-1治疗富胶原实体瘤的GeoMx数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260598

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们最近报道，在难治性肺癌来源的模型中，对PD-1阻断的耐药性与胶原沉积增加以及胶原结合抑制性受体白细胞相关免疫球蛋白样受体1（LAIR1）有关，因此我们假设LAIR1与胶原协同作用以抑制治疗反应。在此，我们报道LAIR1与肿瘤基质相关，并在人肿瘤和小鼠癌症模型的瘤内髓系细胞中高表达。基质相关髓系细胞表现出抑制性表型，并与人类癌症中LAIR1的表达相关。NGM438是一种新型人源化LAIR1拮抗剂单克隆抗体，通过结合LAIR1并阻断胶原结合，引发髓系炎症和同种异体T细胞反应。此外，一种小鼠反应性NGM438替代抗体使难治性KP小鼠肺部肿瘤对抗PD-1治疗敏感，并导致瘤内CD8+ T细胞含量和炎症基因表达增加。

这些数据将LAIR1置于基质与抑制性髓系细胞的交汇点，并支持了阻断LAIR1/胶原轴有可能在临床上解决检查点抑制剂治疗耐药问题的观点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。