草药数字化:消化类草药诱导转录组测序_第二批_A549_batchB

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/肺癌分类,聚焦消化类草药(DHM)在 A549 细胞系中诱导的转录表达及作用模式(MOA)

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基因组回归GPL302099606
GSE252815: Digital transformation of herbal medicine: Conversion to biological entity data using digestive herbal medicine-induced transcriptome sequencing_second_A549_batchB

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

草药数字化:消化类草药诱导转录组测序_第二批_A549_batchB

Digital transformation of herbal medicine: Conversion to biological entity data using digestive herbal medicine-induced transcriptome sequencing_second_A549_batchB

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于肿瘤/肺癌分类,聚焦消化类草药(DHM)在 A549 细胞系中诱导的转录表达及作用模式(MOA)。研究使用消化类草药水提取物(THW)和乙醇提取物(THE)处理细胞,通过高通量测序获得表达谱数据,用于识别 DHM 诱导的转录本。数据集包含 1 个文件,样例为 GSE252815_series_matrix.txt.gz,作者为 Musun、Park,发布时间为 Jan 09 202。该数据可用于分析草药提取物对肺癌细胞转录组的影响,并探索其潜在生物学效应与作用机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 09 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在识别消化相关草药(DHM)诱导的转录表达以及 DHM 在 A549 细胞系中的作用模式(MOA)。为产生 THM 诱导的转录本,使用了消化草药水提取物(THW)和消化草药乙醇提取物(THE)。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL30209、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE252815

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 02 202,引用时请注意版本时效。

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数据说明

This study aimed to identify transcript expression induced by digestion-related herbal medicines (DHM) and modes of action (MOA) of DHM in A549 cell line. For the production of THM-induced transcripts, digestion herbal medicines water extract (THW) and digestion herbal medicines ethanol extract (THE) were used.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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