TSA处理不同时间点A549细胞的mRNA表达谱
该数据集为A549肺癌细胞经TSA（HDAC抑制剂）处理不同时间点后的mRNA表达谱，采用高通量测序获得，包含1个文件GSE244427_series_matrix.txt.gz
基本信息
资源简介
TSA处理不同时间点A549细胞的mRNA表达谱
mRNA expression profiling of A549 cells treated with TSA at different time points
该数据集为A549肺癌细胞经TSA（HDAC抑制剂）处理不同时间点后的mRNA表达谱，采用高通量测序获得，包含1个文件GSE244427_series_matrix.txt.gz。研究背景是细胞衰老伴随基因表达网络改变，作者开发了基于机器学习的PreCSenM模型，以CS score量化衰老水平，并预测肺腺癌临床结局，发现HDAC抑制剂可诱导LUAD细胞衰老。该数据可用于分析HDACi诱导肺癌细胞衰老过程中的转录动态，支持衰老评分建模及肺癌治疗相关研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Oct 01 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：细胞衰老（CS）是指细胞周期稳定停滞，其特征是基因表达网络谱发生改变。然而，目前缺乏可靠的方法来量化衰老水平。在此，我们开发了一种基于机器学习的工具（预测性细胞衰老模型，PreCSenM），通过整合多平台数据中的衰老特征，将衰老水平定义为CS评分，从而解决这一问题。在将该模型应用于预测肺腺癌（LUAD）患者的临床结局时，PreCSenMo发现HDAC抑制剂（HDACi）可触发LUAD细胞衰老。为了揭示HDACi诱导肺癌细胞衰老的转录谱动态，我们对不同时间点经TSA处理的A549细胞进行了RNA-seq。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL24676、9606。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244427
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 29 202，引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
细胞衰老(CS)是指细胞周期稳定停滞，其特征是基因表达网络谱发生改变。然而，目前缺乏一种可靠的方法来量化衰老水平。在此，我们开发了一种基于机器学习的工具(预测性细胞衰老模型，PreCSenM)，通过整合多平台数据中的衰老特征，将衰老水平定义为CS评分，从而解决了这一问题。在应用该模型预测肺腺癌(LUAD)患者的临床结局时，PreCSenM发现HDAC抑制剂(HDACi)能够触发LUAD细胞衰老。为了揭示HDACi诱导肺癌细胞衰老的转录谱动态变化，我们对不同时间点经TSA处理的A549细胞进行了RNA-seq。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
