非小细胞肺癌患者血小板尘埃小RNA图谱

数据通过高通量测序进行非编码RNA分析,平台为GPL24676,物种为9606(人类)。可用于研究肺癌相关血小板尘埃中的

geo
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基因组GPL246769606
GSE244416: Small RNA Landscape of Platelet Dust: Platelet-Derived Extracellular Vesicles from Patients with Non-Small-Cell Lung Cancer

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

非小细胞肺癌患者血小板尘埃小RNA图谱

Small RNA Landscape of Platelet Dust: Platelet-Derived Extracellular Vesicles from Patients with Non-Small-Cell Lung Cancer

该数据集来自NCBI GEO,标题为“Small RNA Landscape of Platelet Dust: Platelet-Derived Extracellular Vesicles from Patients with Non-Small-Cell Lung Cancer”,聚焦非小细胞肺癌患者血小板衍生细胞外囊泡(血小板尘埃)的小RNA图谱。数据通过高通量测序进行非编码RNA分析,平台为GPL24676,物种为9606(人类)。数据集包含1个文件(GSE244416_series_matrix.txt.gz),由Mafalda Antunes-Ferreira于2024年9月30日发布。可用于研究肺癌相关血小板尘埃中的。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 30 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):摘要:背景:血小板来源的细胞外囊泡,或称“血小板尘埃”(PD),是

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244416

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 04 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

摘要:背景:血小板来源的细胞外囊泡,即“血小板尘埃”(PD),据报道是血浆中最丰富的细胞外囊泡。然而,PD的分子内容物,尤其是小RNA谱,仍鲜有表征。本研究旨在表征非小细胞肺癌(NSCLC)患者的PD及其他细胞外囊泡(EVs),重点关注其小RNA特征及诊断潜力。方法:利用表面标志物CD9、CD63、CD81(总EVs)及CD61(PD),直接从健康供者和NSCLC患者血浆中分离EVs。随后进行小RNA测序,以全面分析miRNA谱。结果:我们的分析揭示了NSCLC患者EVs与PD中不同的小RNA谱。与健康对照相比,NSCLC患者中EVs(CD9、CD63和CD81阳性)显示4种miRNA富集和10种miRNA缺失,而PD(CD61阳性)则呈现更复杂的谱,有19种miRNA富集和9种miRNA缺失。

结论:这项探索性研究加深了我们对不同血浆囊泡群体中miRNA组成的理解,揭示了血浆囊泡及其内容物的生物学特性。此外,采用具有潜在临床适用性的细胞外囊泡分离方法,通过选择最具信息量的血浆囊泡亚群,为改善癌症表征和检测提供了前景。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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