肺癌胸膜转移中间皮细胞与肿瘤上皮细胞交互作用数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242951

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在晚期肺癌中，肿瘤转移常累及胸膜，并与不良预后相关，但目前尚缺乏在单细胞分辨率下对不同细胞类型及其相互作用进行系统性研究。本研究通过整合来自肺癌和对照样本的180785个单细胞，发现间皮细胞（胸膜的主要细胞类型）在肿瘤与对照之间展现出最为显著不同的转录组图谱。间皮细胞被划分为四种亚型，其中一种主要在恶性胸腔积液中检出，其特征为在从正常间皮细胞演化的轨迹中富集了癌症相关通路（如细胞迁移）。癌症相关间皮细胞与不同亚型的恶性上皮细胞表现出多样的相互作用，且多种配体/受体与不良预后显著相关。实验表明，通过共培养实验，间皮细胞可增强肺癌细胞的迁移能力，而EGFR是癌细胞中唯一受与间皮细胞相互作用影响且与不良预后相关的基因。

使用EGFR拮抗剂西妥昔单抗可阻止由间皮细胞诱导的肺癌细胞侵袭性增强。此外，通过空间分布分析支持了EPGN-EGFR相互作用，揭示了EPGN+间皮细胞与EGFR+上皮细胞之间的显著邻近关系。我们的发现强调了间皮细胞及其与癌细胞相互作用在肺癌胸膜转移中的重要作用，这可能促进癌症进展。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。