常规培养条件下癌细胞的比较转录组

该数据集来自 NCBI,包含常规培养条件下 PC9、PC9-BrM4 与 PC9-AMG 人肺癌细胞的比较基因表达分析数据,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL18573

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基因组分类GPL185739606
GSE242017: Comparative transcriptome of cancer cells cultured in a conventional manner

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-07

资源简介

常规培养条件下癌细胞的比较转录组

GSE242017 数据集来自 NCBI,主题为常规培养条件下人肺癌细胞的比较转录组分析。该数据集以 PC9、PC9-BrM4 与 PC9-AMG 三种人肺癌细胞为研究对象,采用高通量测序进行基因表达谱分析,物种为人类(9606),测序平台为 GPL18573。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE242017_series_matrix.txt.gz,属于肿瘤/肺癌分类,作者为 Kojiro Ishibashi,发布时间为 Aug 31 202。该数据集可用于了解三种细胞在常规培养条件下的基因表达差异,为相关研究提供表达谱层面的参考数据。

【数据集背景】

该数据集围绕人肺癌细胞的比较转录组展开。源站标题为“Comparative transcriptome of cancer cells cultured in a conventional manner”,即常规培养方式下癌细胞的比较转录组。源站描述进一步说明,该研究针对 PC9、PC9-BrM4 与 PC9-AMG 三种人肺癌细胞,在常规培养条件下开展比较基因表达分析。数据集归入肿瘤/肺癌分类,主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL18573 和 9606,分别指向高通量测序表达谱分析、所用平台以及人类物种。作者为 Kojiro Ishibashi,发布时间为 Aug 31 202。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE242017_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包格式,内容对应系列矩阵数据。源站描述表明,数据内容为 PC9 与 PC9-BrM4、PC9-AMG 人肺癌细胞在常规培养条件下的比较基因表达分析结果。主题标签显示数据属于高通量测序表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL18573。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、基因数量、具体表达值或分组重复等更细的内容说明。

【采集与来源】

数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI。源站描述说明该数据来自对 PC9、PC9-BrM4 与 PC9-AMG 人肺癌细胞在常规培养方式下的比较基因表达分析。数据采用高通量测序进行表达谱分析,物种为人类(9606),平台为 GPL18573。作者为 Kojiro Ishibashi,发布时间为 Aug 31 202。关于样本采集地点、培养条件细节、测序机构及伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于人肺癌细胞表达谱的比较分析场景,尤其是针对 PC9、PC9-BrM4 与 PC9-AMG 三种细胞在常规培养条件下的基因表达差异研究。由于主题标签为 Expression profiling by high throughput sequencing,数据可用于高通量测序表达谱相关的方法学习与流程验证。数据集分类为肿瘤/肺癌,也可作为肺癌细胞转录组研究的参考数据。关于具体生物学结论或临床转化用途,源站未提供,不应超出数据本身进行推断。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE242017_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。由于数据集仅包含 1 个文件,使用时应以该系列矩阵文件为主要数据入口。关于是否需要额外注释文件、平台注释细节或标准化流程,源站未提供,使用时可结合平台 GPL18573 的公开信息自行确认。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE242017_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。源站未提供样本量、重复数、测序深度、数据质控指标或缺失值情况等质量相关信息。数据描述限于常规培养条件下 PC9、PC9-BrM4 与 PC9-AMG 人肺癌细胞的比较基因表达分析,未提供其他培养条件或体内实验数据。发布时间为 Aug 31 202,年份信息不完整。使用时应以源站记录为准,并注意数据覆盖范围有限。

【引用与许可】

作者为 Kojiro Ishibashi,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款和使用限制,源站未提供。使用或再分发前应查阅 NCBI 源站页面以确认最新要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242017

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Comparative gene expression analysis of PC9 versus PC9-BrM4 versus PC9-AMG human lung cancer cells cultured in a conventional manner.

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