GSE241236:诱导葡萄糖向酮体代谢转换编程生酮饮食诱导的肺癌治疗脆弱性

该数据集来自 NCBI GEO,标题为诱导葡萄糖向酮体代谢转换编程生酮饮食诱导的肺癌治疗脆弱性,包含 1 个文件 GSE241236_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为人类(9606),平台为 GPL20301

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基因组分类GPL203019606
GSE241236: Induction of a metabolic switch from glucose to ketone metabolism programs ketogenic diet-induced therapeutic vulnerability in lung cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

GSE241236:诱导葡萄糖向酮体代谢转换编程生酮饮食诱导的肺癌治疗脆弱性

GSE241236 是一个来自 NCBI GEO 的高通量测序表达谱数据集,标题为“Induction of a metabolic switch from glucose to ketone metabolism programs ketogenic diet-induced therapeutic vulnerability in lung cancer”,即“诱导葡萄糖向酮体代谢转换编程生酮饮食诱导的肺癌治疗脆弱性”。该数据集属于肿瘤/肺癌方向,聚焦肺癌中与酮体代谢相关的代谢脆弱性探索,物种为人类(9606),平台为 GPL20301,共包含 1 个数据文件 GSE241236_series_matrix.txt.gz,以 GZIP 压缩格式提供。数据集作者为 Zhengwei,Wu,发布时间为 Aug 18 202。整体而言,该数据集为研究肺癌代谢重编程,特别是葡萄糖代谢向酮体代谢转换及生酮饮食相关治疗脆弱性提供了可用的基因表达谱资源。

【数据集背景】

该数据集围绕肺癌的代谢脆弱性展开。源站描述指出,其目的在于探索肺癌中与酮体代谢相关的代谢脆弱性。数据集标题进一步表明,研究关注的是诱导葡萄糖代谢向酮体代谢转换,并由此编程生酮饮食诱导的肺癌治疗脆弱性。这一背景提示,该数据集服务于肿瘤代谢研究方向,尤其是肺癌细胞在糖代谢与酮体代谢之间的转换如何影响治疗反应。该数据集被归类为肿瘤/肺癌,说明其研究对象与肺癌直接相关,适合用于肺癌代谢机制及治疗策略相关的表达谱分析。

【数据内容】

该数据集属于高通量测序表达谱数据,主题标签为“Expression profiling by high throughput sequencing”,物种为人类(9606),平台为 GPL20301。数据集共包含 1 个文件,文件样例为 GSE241236_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。该文件为系列矩阵文件,通常用于承载表达谱数据的样本信息与表达值矩阵。数据集未提供更多关于样本数量、分组设计、具体基因数量或表达值分布的信息,源站未提供。数据内容的核心用途是支持对肺癌中葡萄糖向酮体代谢转换相关表达变化的分析。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据集英文名为 GSE241236,源站标题与数据集标题一致,均为“Induction of a metabolic switch from glucose to ketone metabolism programs ketogenic diet-induced therapeutic vulnerability in lung cancer”。作者为 Zhengwei,Wu,发布时间为 Aug 18 202。数据集所属分类为肿瘤/肺癌,主题标签包括高通量测序表达谱、GPL20301 和 9606。除上述来源信息外,关于样本采集地点、伦理审批、实验处理细节等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肺癌代谢研究相关场景,尤其是围绕葡萄糖代谢与酮体代谢转换、生酮饮食诱导的治疗脆弱性等主题的表达谱分析。研究者可将其用于探索肺癌中与酮体代谢相关的基因表达模式,或作为高通量测序表达谱数据用于方法学验证与比较分析。由于数据集归类为肿瘤/肺癌,也可用于肺癌治疗脆弱性相关的二次分析。需要说明的是,具体适用分析类型(如差异表达分析、通路富集分析等)需依据数据文件实际内容确定,源站未提供相关分析建议。

【使用方法】

使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE241236_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,读取前需按 GZIP 格式解压或直接以相应方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认数据格式、样本标识和表达值编码无误后,再进行批量接入与分析。由于数据集仅包含 1 个文件,使用时应以该系列矩阵文件为主要数据入口。关于具体的读取工具、字段含义和预处理步骤,源站未提供,需结合文件实际内容判断。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本组成信息有限,源站未提供样本数量、重复设置、测序深度、质控指标等质量相关信息。因此,在使用前应自行核对文件完整性与字段一致性。数据集标题和描述聚焦于酮体代谢与生酮饮食相关治疗脆弱性,但具体实验设计、对照设置和统计方法源站未提供。该数据集的物种为人类(9606),平台为 GPL20301,使用时应确认平台注释与表达值类型的匹配性。总体而言,该数据集可作为表达谱资源使用,但其质量评估需依据文件实际内容和后续分析验证。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Zhengwei,Wu,发布时间为 Aug 18 202。数据集来源于 NCBI GEO,源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款和使用限制,源站未提供。使用者在引用或再分发该数据集时,应遵循 NCBI GEO 的相关政策及源站要求,具体许可信息需以源站页面为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE241236

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

To explore metabolic vulnerabilities in lung cancer, relating to ketone metabolism

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