GSE238188：小细胞肺癌患者循环肿瘤细胞与外泌体中JUNB和CXCR4表达研究

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE238188

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数据说明

小细胞肺癌增强的转移能力凸显了发现预后生物标志物以支持疾病病程中决策的必要性。我们此前已证明JUNB和CXCR4表达在乳腺癌和非小细胞肺癌（NSCLC）患者循环肿瘤细胞（CTC）中的临床意义。在本研究中，我们旨在探索上述生物标志物在患者CTC及血浆来源外泌体中的表达水平。研究纳入了一百名基线期SCLC患者；其中58名进行了外泌体分离。使用VyCAP系统分析细胞离心涂片，并基于分子和转录组谱对外泌体进行表征。JUNB和CXCR4在大多数CTC中表达。患者中两种生物标志物的外泌体蛋白表达与健康供者相比存在显著差异（分别为p = 0.003和p = 0.027），而在外泌体中过表达JUNB和CXCR4的患者中观察到高区分能力（c统计量分别为0.949和0.903）。CTC中JUNB和/或CXCR4的存在与较差的OS相关（p = 0.025）。

CXCR4在外泌体中的过表达与循环肿瘤细胞（CTCs）的存在及其表型相关。最后，对4例小细胞肺癌（SCLC）患者进行的miRNA分析显示了众多参与SCLC发病机制的生物学过程和信号通路。我们的研究首次尝试评估SCLC患者液体活检的两个不同方面（CTCs和外泌体），关注JUNB和CXCR4的表达，旨在提供一种潜在的新预后和/或诊断方法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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