全基因组体内CRISPR激活筛选鉴定BACE1为肺癌脑转移治疗脆弱性靶点

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE237446

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑转移发生于高达40%的非小细胞肺癌（NSCLC）患者中。原发肺肿瘤与其相应的脑转移灶之间存在相当大的基因组异质性；然而，能够驱动脑转移的基因身份尚未被完全阐明。在此，我们开展了一项体内全基因组CRISPR激活（CRISPRa）筛选，以从NSCLC患者来源异种移植模型中鉴定脑转移的分子驱动因素。我们发现，阿尔茨海默病相关的β-位点淀粉样前体蛋白裂解酶1（BACE1）的激活导致脑转移显著增加。此外，BACE1敲除或用MK-8931处理进行抑制可阻断NSCLC脑转移。在机制上，我们发现BACE1切割EGFR的N端片段，从而通过MEK和ERK激活下游信号传导并驱动这种转移表型。总之，我们的数据凸显了体内CRISPR筛选在揭示NSCLC脑转移的新型分子驱动因素和潜在治疗靶点方面的能力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。