GSE236401：核仁TAAP1/C22orf46赋予非小细胞肺癌促生存信号

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236401

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤细胞通过利用抑制性信号来颠覆免疫监视，从而获得免疫抵抗。双特异性抗体已被开发用于将细胞毒性T淋巴细胞导向肿瘤部位并促进其活性，以降低肿瘤免疫抵抗。尽管双特异性抗体应用取得了成功，但并非普遍有效，部分原因是肿瘤细胞表达促生存因子。在此，我们报告了一项在人非小细胞肺癌中进行的CRISPR/Cas9筛选，旨在寻找使肿瘤对T淋巴细胞介导的杀伤产生更强抵抗力的基因。我们发现，不表达C22orf46基因的肺癌细胞对T细胞诱导的凋亡以及化疗药物介导的基因毒性应激表现出更高的敏感性。我们提供的数据表明，C22orf46——先前被注释为非编码基因——编码一种表达的核仁蛋白，与含有BH结构域的Bcl-2家族具有远缘同源性，并建议将该蛋白命名为肿瘤凋亡相关蛋白1（TAAP1）。总之，我们的研究结果确立了TAAP1/C22orf46作为一种促生存癌基因，可能对治疗具有重要意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。