PD-1阻断通过增加CD127+和KLRG1+ CD8 T细胞增强NSCLC新辅助化疗

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE229353

标准获取流程：

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数据说明

与单纯新辅助化疗（NAC）相比，PD-1阻断联合新辅助化疗在非小细胞肺癌（NSCLC）中取得了前所未有的临床成功，但PD-1阻断增强化疗效果的潜在机制仍未完全阐明。对接受NAC或新辅助帕博利珠单抗联合化疗（NAPC）的7例NSCLC患者手术切除的新鲜肿瘤组织中分离的CD45+免疫细胞进行了单细胞RNA测序。对65例可切除NSCLC患者NAC或NAPC前后的配对FFPE组织进行了多重荧光免疫组化，并用GEO数据集验证了结果。NAC仅导致CD20+ B细胞增加，而NAPC增加了CD20+ B细胞、CD4+ T细胞、CD4+CD127+ T细胞、CD8+ T细胞、CD8+CD127+和CD8+KLRG1+ T细胞的浸润。B细胞和T细胞的协同增加促进了NAPC后有利的治疗反应。空间分布分析发现，与NAC相比，NAPC中CD8+ T细胞及其CD127+和KLRG1+亚群与CD4+ T/CD20+ B细胞的距离更近。

GEO数据集验证了B细胞、CD4、记忆性和效应性CD8特征与治疗反应及临床结局相关。在NAC基础上加入PD-1阻断可通过肿瘤微环境中T细胞和B细胞的募集促进抗肿瘤免疫，并诱导肿瘤浸润CD8+ T细胞向CD127+和KLRG1+表型偏移，这可能有CD4+ T细胞和B细胞的辅助作用。我们的综合研究识别了在PD-1阻断治疗期间发挥抗肿瘤反应的关键免疫细胞亚群，这些亚群或可作为治疗靶点，以改进现有的NSCLC免疫疗法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。