肺癌骨转移单细胞转录组图谱

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肺癌骨转移单细胞转录组图谱

GSE225209 是一个面向肺癌骨转移研究的单细胞转录组数据集，源站标题为 Single-cell transcriptome profiling of lung cancer bone metastasis，由 Xiaoshen、Zhang 提交，于 2023 年 2 月 13 日发布，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集以高通量测序方式对人类（9606）转移病灶开展单核转录组分析，平台编号为 GPL24676，主题归类为 Expression profiling by high throughput sequencing。数据集包含 1 个文件，样例文件名为 GSE225209_series_matrix.txt.gz，本站将其归入肿瘤 / 肺癌分类。整体而言，该数据集可用于考察肺癌骨转移病灶中的细胞异质性与分子特征，为相关基础与转化研究提供转录组层面的数据基础。

【数据集背景】

肺癌骨转移是肺癌进展过程中的重要临床问题，转移病灶内不同细胞群体的构成与状态直接影响疾病行为。该数据集聚焦肺癌骨转移的转移病灶，采用单核转录组分析策略获取表达谱信息，主题标签为 Expression profiling by high throughput sequencing，物种为人类（9606），测序平台为 GPL24676。源站描述指出其针对肺癌骨转移的转移病灶进行单核转录组分析，说明该数据面向转移微环境与细胞组成的研究需求。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE225209_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵形式的表达谱数据文件。主题标签表明数据通过高通量测序产生，平台为 GPL24676，物种为人类（9606）。源站描述强调对转移病灶开展单核转录组分析，因此数据内容对应转移病灶样本的单核转录组表达信息。关于样本数量、细胞数目、基因数目、分组设计等具体细节，源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，作者为 Xiaoshen、Zhang，发布时间为 2023 年 2 月 13 日。源站标题为 Single-cell transcriptome profiling of lung cancer bone metastasis，源站描述为 Single nuclei transcriptome profiling of metastatic lesions for lung cancer bone metastasis。采集对象为人类肺癌骨转移的转移病灶，采集技术路线为高通量测序，平台编号 GPL24676。样本采集地点、伦理审批信息、测序深度等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究肺癌骨转移病灶的细胞异质性和分子特征，适合围绕转移病灶内细胞群体构成、表达谱差异等方向开展探索性分析。由于采用单核转录组分析，可用于需要从转移病灶获取转录组信息的场景。具体可支持的比较分析类型、临床关联分析等，源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE225209_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。关于配套的注释文件、分析脚本或标准化流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，样例为系列矩阵压缩文件，具体质控指标、细胞过滤标准、批次信息等，源站未提供。数据基于单核转录组分析，源站描述未涉及其他组学层面。样本量、重复数及平台运行细节等影响解读的因素，源站未提供。

【引用与许可】

数据作者为 Xiaoshen、Zhang，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 2023 年 2 月 13 日。关于使用许可、引用格式及数据再分发条件，源站未提供。