共表达CD38和CD39的肿瘤浸润CD4+ T细胞群体与检查点抑制剂耐药相关

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE224099

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们此前已发现，外周血中一类以CD3+CD4+CD127-GARP-CD38+CD39+标记组合定义的T细胞群体频率升高，与转移性黑色素瘤患者的检查点免疫治疗耐药相关。本研究旨在进一步阐明这一表达胞外酶的T细胞群体（Teee）的作用。我们采用RNA测序和流式细胞术评估转移性黑色素瘤患者外周血中的Teee，发现Teee具有增殖性、凋亡性，表现出耗竭相关表型，并高表达抑制性分子。体外将患者Teee与自体T细胞共培养，可抑制靶T细胞的增殖。利用单细胞RNA测序数据集，我们在黑色素瘤、非小细胞肺癌和膀胱癌患者肿瘤中鉴定出具有Teee基因特征的独特细胞簇。健康膀胱组织中未检测到Teee。

通过对黑色素瘤患者FFPE肿瘤样本进行多光谱免疫荧光分析，我们能够在肿瘤微环境中鉴定出共表达CD38和CD39的CD4+ T细胞，这些细胞优先与Ki67- CD8+ T细胞相关联。最后，我们发现，具有Teee基因特征的细胞在瘤内的高基线频率与转移性黑色素瘤患者的检查点免疫治疗耐药及较差的总生存期相关。这些结果建立在我们先前发现的基础上，表明在患者外周和肿瘤中存在一群新型的共表达CD38和CD39的CD4+ T细胞，且与检查点免疫治疗耐药相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。