肺癌小鼠模型中免疫细胞的基因表达

该数据集来自 NCBI GEO(GSE222158),收录了肺癌小鼠模型中免疫细胞的基因表达数据。研究采用分泌 CCL21 的自体树突状细胞进行原位疫苗接种,联合免疫检查点抑制剂 anti-PD-1,治疗癌基因驱动的非小细胞肺癌小鼠模型,并对处理后的肿瘤组织进行单细胞转录组测序

geo
浏览 1
基因组分类GPL2424710090
GSE222158: Gene expression of immune cells in a lung cancer mouse model

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-07

资源简介

肺癌小鼠模型中免疫细胞的基因表达

GSE222158 数据集收录于 NCBI GEO,主题为肺癌小鼠模型中免疫细胞的基因表达。研究采用分泌 CCL21 的自体树突状细胞进行原位疫苗接种,联合免疫检查点抑制剂 anti-PD-1,治疗癌基因驱动的非小细胞肺癌小鼠模型,并对处理后的肿瘤组织开展单细胞转录组测序,从而获得处理后癌组织的单细胞转录组数据。该数据集属于肿瘤/肺癌方向,采用高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠,包含 1 个数据文件,适合关注肺癌免疫微环境与联合治疗转录组响应的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集围绕癌基因驱动的非小细胞肺癌小鼠模型展开。研究者在治疗层面采用原位疫苗接种策略,使用分泌 CCL21 的自体树突状细胞,并与免疫检查点抑制剂 anti-PD-1 联合应用。研究的观测对象是经上述处理后的癌症组织,通过单细胞转录组测序刻画其中免疫细胞的基因表达情况。这一背景将树突状细胞疫苗、免疫检查点阻断与肺癌组织单细胞表达谱联系在一起,为理解联合治疗下肿瘤组织免疫细胞的转录状态提供了数据基础。

【数据内容】

数据集提供处理后癌症组织的单细胞转录组测量结果,核心内容为免疫细胞的基因表达数据。数据以高通量测序的表达谱分析形式产生,主题标签中包含 GPL24247 与 10090,分别对应所使用的平台与小鼠物种信息。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE222158_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件,通常用于承载样本层面的表达信息。数据内容聚焦于治疗后的肿瘤组织,而非未经处理的对照组织描述,源站未提供更细分的细胞类型清单或基因数量等细节。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO,源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名与源站标题均为“Gene expression of immune cells in a lung cancer mouse model”。作者为 Ramin、Salehi-rad,发布时间为 Jan 04 202。采集过程对应小鼠肺癌模型的治疗实验:以分泌 CCL21 的自体树突状细胞进行原位疫苗接种,联合 anti-PD-1 治疗,随后对处理后的癌症组织进行单细胞转录组测序。数据以 GZIP 压缩的系列矩阵文件形式提供下载。

【适用场景】

该数据集适用于肺癌免疫治疗相关的转录组研究场景,例如考察树突状细胞疫苗联合 anti-PD-1 处理后肿瘤组织免疫细胞的基因表达特征,分析单细胞层面的表达谱结构,或作为肺癌小鼠模型免疫微环境研究的参考数据。由于数据来自处理后癌组织的单细胞转录组测量,也可用于方法学上的数据读取、字段核对与流程验证等用途。源站未提供具体的差异表达分析结果或临床转化结论。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE222158_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因文件解析或编码问题导致后续分析偏差。由于该数据集仅包含 1 个系列矩阵文件,使用时应先明确该文件所承载的样本与表达信息结构,再结合单细胞转录组分析流程进行后续处理。源站未提供配套的分析代码或详细处理参数。

【质量与限制】

数据集为 GEO 收录的系列矩阵文件,文件数量为 1,源站未提供样本量、测序深度、细胞数量等具体质控指标,也未提供批次信息或对照设计的详细说明。数据仅涉及处理后癌症组织的单细胞转录组测量,源站描述中未提及未处理对照或重复实验的细节。使用者在解读结果时应注意这些信息缺口,不宜超出数据本身所能支持的范围作出推断。物种为小鼠,向人类临床结论的外推需谨慎。

【引用与许可】

引用时应参考 NCBI GEO 中该数据集的正式记录,数据集英文名为 GSE222158: Gene expression of immune cells in a lung cancer mouse model,作者为 Ramin、Salehi-rad,发布时间为 Jan 04 202。源站未提供具体的许可条款信息,使用与再分发前应查阅 NCBI GEO 的相关使用政策与源站记录。源站未提供其他引用格式或授权细节。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222158

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们在小鼠模型中采用分泌CCL21的自体树突状细胞进行原位疫苗接种,联合免疫检查点抑制剂抗PD-1,治疗癌基因驱动的非小细胞肺癌。并检测了治疗后癌组织的单细胞转录组。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。