GSE216729：致癌性脂肪酸氧化感知睡眠不足诱导的昼夜节律紊乱以促进肿瘤发生[昼夜节律]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE216729

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

睡眠不足和昼夜节律紊乱与癌症患者的不良预后相关，然而睡眠缺乏（SD）如何破坏促进肿瘤生长和发展的昼夜节律细胞生物学过程仍不清楚。为研究睡眠缺乏对肿瘤发生的影响，我们评估了睡眠缺乏处理（7周）后KRASG12D/WT小鼠肺部的基因表达。通过对SD小鼠肺部肿瘤中显著上调基因进行基因本体论（GO）富集分析，我们发现脂质代谢过程富集于前20个GO条目中。脂质代谢组学结果显示，SD在肺部肿瘤发生过程中显著刺激脂肪酸氧化过程。此外，对脂肪酸氧化（FAO）关键调控因子ACSL1的基因敲除显著逆转了SD促进的肺部肿瘤发展。此外，SD触发的脂肪酸氧化增强了癌症干细胞样特性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。