GSE204944：鉴定 miR-151a 作为人癌症中外泌体货物归一化的通用内源性对照

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE204944

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数据说明

癌症患者血液中的外泌体颗粒所携带的肿瘤标志物比游离循环中的多许多倍。在这些成分中，miRNA因其稳定性和可检测性而具有重要的生物医学意义。然而，目前市场上尚无可靠的外泌体区室内源性对照品，也没有针对miRNA含量的特异性对照品，这阻碍了癌症液体活检中标准化措施的建立。在本研究中，我们首先从九个潜在内参中鉴定出三个miRNA，这些潜在内参来源于一项整合分析，该分析通过miRNA-seq比较了六种肺癌和卵巢癌人类细胞系在不同化疗条件下的全局外泌体miRNA谱。我们还在一另外14种来自不同肿瘤类型的人类癌细胞系中测试了它们作为内参的价值，并在放疗和另一种化疗处理后进行了验证。其转化验证包括124份前瞻性样本，其中70份来自NSCLC患者的血浆、12份来自胶质母细胞瘤患者、10份来自健康供者，以及16份来自卵巢癌患者血浆和腹水的配对样本。

以组织来源的金标准miR-16为对照，检测了其变异性和归一化特性。我们的结果表明，与miR16相比，无论所测试的多种条件如何，miR-151a在外泌体内容物中均稳定存在且变异性极小，首次为外泌体区室提供了一种通用的归一化因子，这将对液体活检的应用产生影响。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。