实体人类肿瘤中小RNA及microRNA的发现:测序数据
该数据集来自NCBI,包含实体人类肿瘤中小RNA的高通量测序数据,覆盖乳腺、膀胱、结肠和肺肿瘤样本。研究通过测序鉴定出49个新miRNA及类miRNA小RNA,并在多种血液、正常与肿瘤组织中验证了10个新小RNA的表达,同时发现源自Y-RNA的高表达小RNA和内源性siRNA等新类别

基本信息
资源简介
实体人类肿瘤中小RNA及microRNA的发现:测序数据
Discovery of microRNAs and other small RNAs in solid human tumors: sequencing
该数据集来自NCBI,包含实体人类肿瘤中小RNA的高通量测序数据,覆盖乳腺、膀胱、结肠和肺肿瘤样本。研究通过测序鉴定出49个新miRNA及类miRNA小RNA,并在多种血液、正常与肿瘤组织中验证了10个新小RNA的表达,同时发现源自Y-RNA的高表达小RNA和内源性siRNA等新类别。数据可用于肿瘤相关非编码RNA的发现、表达差异分析及肿瘤类型与分期比较研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 18 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):MicroRNAs(miRNAs)是约22个核苷酸长的非编码RNA,调控基因沉默。已知许多人类miRNA在多种肿瘤中失调。本文报告了利用高通量测序对23份乳腺、膀胱、结肠和肺肿瘤样本中的小RNA进行测序。我们鉴定出49个新的miRNA和类miRNA小RNA。我们进一步使用两个独立平台(即微阵列和RT-PCR)在31种不同的血液、正常和肿瘤组织样本中验证了10个新小RNA的表达。一些新序列在肿瘤与肿瘤邻近组织之间、不同肿瘤分期之间或不同肿瘤类型之间显示出较大表达差异。我们还报告了人类中新小RNA类别的鉴定:源自Y-RNA的高表达小RNA和内源性siRNA。最后,我们鉴定了数十个新miRNA
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL9186、9606。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE20417
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 16 201,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
微小RNA(miRNA)是一类长度约为22个核苷酸的非编码RNA,参与基因沉默调控。已知许多人类miRNA在多种类型的肿瘤中表达失调。本文报告了利用高通量测序技术对23例乳腺癌、膀胱癌、结肠癌和肺癌样本中的小RNA进行测序的结果。我们鉴定出49个新的miRNA及类miRNA小RNA。进一步采用微阵列和RT-PCR两个独立平台,在31种不同类型的血液、正常组织和肿瘤组织样本中验证了10个新小RNA的表达。部分新序列在肿瘤与瘤旁组织之间、不同肿瘤分期之间或不同肿瘤类型之间表现出较大的表达差异。我们还报告了在人类中鉴定出新的小RNA类别:来源于Y-RNA的高表达小RNA和内源性siRNA。最后,我们鉴定出数十个新的miRNA序列变异体,这些变异体证明了miRNA相关SNP或转录后修饰的存在。本研究拓展了当前对肿瘤小RNA转录组的认识,并为分子生物标志物和药物靶点提供了新的候选分子。
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