GSE158824：STAT3 Ser727与Tyr705磷酸化差异调控EMT-MET转换及肿瘤转移

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE158824

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

上皮-间质转化（EMT）/间质-上皮转化（MET）过程被认为是癌症转移的驱动力。通过研究骨髓来源间充质干细胞（BM-MSC）驱动的肺癌模型中的转移过程，采用系统生物学方法对微阵列时间序列数据进行分析，揭示了BM-MSC诱导的信号在STAT3激活后不久即触发CD133+/CD83+癌症干细胞（CSCs）从原发部位的早期播散，但同时促进其向继发部位的增殖。从迁移到增殖的转换受BM-MSC分泌的LIF调控，并激活LIFR/p-ERK/pS727-STAT3信号通路，从而促进早期播散的癌细胞发生MET及转移前微环境的形成。随后，肿瘤趋向性BM-MSCs循环至原发部位，通过IL6R/pY705-STAT3信号通路触发CD151+/CD38+细胞获得EMT相关的CSC特性，从而促进肿瘤起始，同时这些BM-MSCs也被转移前微环境所吸引并向其迁移。综上所述，STAT3在酪氨酸705和丝氨酸727位点的磷酸化差异化调控不同CSC分子亚型内的EMT-MET转换，从而完成转移过程。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。