肺间充质Tsc2KO引发成年小鼠肺各主要细胞亚群基因表达变化研究

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139818

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤抑制因子结节性硬化症复合体2（TSC2）是哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mTOR）的关键负调控因子，而mTOR是健康和疾病状态下细胞生长与代谢的核心调控者。TSC2缺失会导致罕见肺病——肺淋巴管肌瘤病（LAM）中mTORC1的组成性激活，该病仅影响育龄女性，以肺组织破坏和肺功能进行性丧失为特征。目前对于TSC2缺失如何诱导LAM以及LAM的起源细胞知之甚少。为确定TSC2缺失和mTORC1激活对肺稳态的细胞类型特异性效应，我们构建了新的转基因小鼠，在肺间充质中靶向敲除Tsc2（Tbx4-Cre+Tsc2flox/flox）以及在肺上皮中靶向敲除Tsc2（Shh-Cre+Tsc2flox/flox）。Tbx4-Cre+、Tsc2flox/flox和Shh-Cre+、Tsc2flox/flox小鼠均可存活且具有生育能力。成年Tbx4-Cre+Tsc2flox/flox小鼠表现出肺间充质中mTORC1激活、进行性肺泡扩大、雌性特异性的肺功能下降以及妊娠诱导的病灶生长。

为探究在Tsc2KO肺中观察到的表型变化背后的分子机制，我们对成年雌性8周龄Tsc2KO小鼠肺主要细胞亚群中的基因表达变化进行了比较性bulk-RNAseq分析，并与年龄和性别匹配的WT对照组进行了对比。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。