非小细胞肺癌差异表达转录组研究数据集
该数据集来自 NCBI GEO（GSE138682），利用 Human Transcriptome Array 2.0 系统分析肺腺癌（LUAD）和肺鳞状细胞癌（LUSC）相对于肺对照的全基因组可变剪接事件
基本信息
资源简介
非小细胞肺癌差异表达转录组研究数据集
Differentially-expressed-transcriptome study of Non-Small Cell Lung Carcinoma
该数据集来自 NCBI GEO（GSE138682），利用 Human Transcriptome Array 2.0 系统分析肺腺癌（LUAD）和肺鳞状细胞癌（LUSC）相对于肺对照的全基因组可变剪接事件。数据包含 1 个文件（GSE138682_series_matrix.txt.gz），主题标签涉及表达谱芯片、GPL17586 平台和人类（9606）。可用于肺癌亚型相关的差异表达与可变剪接研究，以及基于表达谱的样本分类分析（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Oct 10 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们通过 Human Transcriptome Array2.0 系统分析了肺腺癌（LUAD）和肺鳞状细胞癌（LUSC）相对于肺对照的全基因组可变剪接事件。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL17586、9606。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE138682
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 21 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE138682
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们通过Human Transcriptome Array2.0系统性地分析了肺腺癌（LUAD）和肺鳞状细胞癌（LUSC）相对于肺部对照的全基因组可变剪接事件。非侵袭性IIIA期非小细胞肺癌（NSCLC）本质上具有异质性，加之5年生存率较低以及75-85%的脑转移或骨转移发生率，使其难以预测、诊断和预后评估。因此，我们假设开发基于转录本的标签来对IIIA期-NSCLC-LUAD和LUSC进行分类，并识别可提示疾病预后的标志物。我们能够通过HTA array2.0更精确地对LUAD和LUSC组织进行分子分类。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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