BL/6 小鼠 Kras、Stk11 和/或 Keap1/Nrf2 改变的转录谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE133714

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对携带突变Kras等位基因的BL/6小鼠进行转录谱分析，这些小鼠伴有或不伴有Stk11和/或Keap1的敲除，或表达Nfe2l2转基因，即Nrf2Tg。在肺腺癌（LUAD）中，约四分之一患者通过KEAP1和NFE2L2的基因组改变导致转录因子NRF2稳定，常伴随STK11抑癌基因缺失。本研究中，我们证明在同时存在KRAS突变和STK11缺失的情况下，NRF2激活促进了人类和小鼠临床前模型中侵袭性LUAD肿瘤行为。此表型与代谢重编程及NRF2对STK11缺失肿瘤中高氧化还原应激的救援相关。应用一种新颖的、泛肺癌诊断性NRF2激活基因表达特征，该特征独立于频繁共现的突变，我们在接受免疫治疗或化疗的二线LUAD患者数据集（OAK试验）中，剖析了人类LUAD中最常见的三个遗传事件（NRF2激活、STK11缺失和KRAS突变）对患者预后和临床反应的独立贡献。

我们的发现强调了致癌和抑癌途径中个体效应及其上位关系对肿瘤生物学、免疫微环境及患者临床结局的影响。我们的工作还突显了基于遗传和表达谱的肺癌疾病亚分类在患者临床管理中的价值。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。