SMARCA4缺失经限制CCND1染色质可及性与CDK4/6合成致死于肺癌

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121755

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤抑制因子SMARCA4（BRG1）是SWI/SNF染色质重塑的关键基因，在癌症中频繁失活，且无法直接作为药物靶点。我们最近发现，在一种卵巢癌亚型中，SMARCA4缺失会导致cyclin D1缺陷，从而对CDK4/6抑制敏感。在此，我们证明这种脆弱性在非小细胞肺癌（NSCLC）中同样存在，SMARCA4缺失同样导致cyclin D1表达降低，并对CDK4/6抑制剂具有选择性敏感性。此外，SMARCA2——另一种在部分NSCLC中缺失的SWI/SNF亚基——在SMARCA4缺失时也调控cyclin D1和药物反应。机制上，SMARCA2/4缺失通过限制CCND1染色质可及性和抑制c-jun（CCND1的转录激活因子）共同降低cyclin D1表达。此外，SMARCA4缺失与CDK4/6抑制在体外和体内均表现为合成致死，提示FDA批准的CDK4/6抑制剂可能有效治疗这一重要的NSCLC亚群。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。