GSE10025：肺癌中TITF1谱系特异性癌基因扩增的基因组分析：aCGH芯片

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE10025

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数据说明

摘要：肺癌是癌症死亡的主要原因之一，其中癌基因的扩增促进了肿瘤发生。对128个肺癌细胞系和肿瘤的基因组分析显示，在染色体带14q13.3处频繁出现局灶性DNA扩增，而该位点在其他肿瘤类型中并未扩增。复发性扩增的最小区域跨越了同源盒转录因子TITF1（也称为NKX2-1），此前已将其与正常肺发育和功能相关联。当发生扩增时，TITF1在RNA和蛋白质水平均表现出表达增加。在具有扩增的肺癌细胞系中，通过siRNA介导的TITF1敲低导致细胞增殖减少，表现为细胞周期进程减慢和细胞凋亡增加。我们的发现表明，TITF1扩增和过表达有助于肺癌细胞增殖率和存活，并提示TITF1是肺癌中的谱系特异性癌基因。按共享生物学背景（如生物体、肿瘤类型、过程等）组织的阵列集。细胞系关键词：逻辑集

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。