早期NSCLC癌旁气道区域癌化基因表达谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-44077

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

既往研究表明，肺肿瘤与外观正常的邻近肺组织共享某些特定异常，这些异常可能与肺癌的发病机制高度相关。然而，非小细胞肺癌（NSCLC）中整体及分子层面的邻近气道区域癌化现象此前尚未被阐明。我们试图理解邻近气道区域癌化的转录组结构，并结合肿瘤特征，以进一步洞察肺癌生物学及肿瘤发生机制。我们利用Affymetrix Human Gene 1.0 ST平台，对配对的NSCLC肿瘤、与肿瘤距离不等的多个正常气道上皮以及未受累的正常肺组织进行了转录组分析。我们分析了气道区域癌化转录组，以确定邻近气道中全局差异表达的癌化谱，以及可能受肿瘤距离调节的气道表达谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。