转染scrambled siRNA与靶向ETS2基因siRNA的肺癌细胞基因表达谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-43459

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

ETS2是一个典型的转录因子，属于ETS基因家族成员。ETS2与广泛基因中的共识ERE结合位点结合，从而影响众多细胞内分子功能。然而，ETS2在肺癌生物学和发病机制中的作用仍不清楚。我们发现，与正常肺组织相比，ETS2在肺肿瘤中表达下调，且该基因编码蛋白的表达是非小细胞肺癌患者有利预后的显著独立预测因子，提示该基因可能具有抑癌作用。为更好地理解其在非小细胞肺癌中的分子功能，我们比较和对比了转染对照siRNA和靶向ETS2 siRNA的肺癌细胞的转录组。H441肺癌细胞转染了SMARTpool（Dharmacon）对照/乱序siRNA或靶向ETS2的siRNA。对转染对照siRNA的细胞和转染ETS2特异性siRNA的细胞分别进行了三次独立转染，每次转染构成一个生物学重复。所有样本中ETS2的敲低均通过定量实时PCR确认。随后使用Human Gene

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。