台湾原发性非小细胞肺癌患者肿瘤与配对正常肺组织的基因表达谱
该数据集来自台湾原发性非小细胞肺癌（NSCLC）患者，包含手术切除的肿瘤组织与配对正常肺组织的全基因组表达谱，采用 Phalanx Human OneArray 芯片检测，共 21 例患者，其中 11 例腺癌、10 例鳞癌，早期（I、II 期）10 例、晚期（III、IV 期）11 例
基本信息
资源简介
台湾原发性非小细胞肺癌患者肿瘤与配对正常肺组织的基因表达谱
该数据集来自台湾原发性非小细胞肺癌（NSCLC）患者，包含手术切除的肿瘤组织与配对正常肺组织的全基因组表达谱，采用 Phalanx Human OneArray 芯片检测，共 21 例患者，其中 11 例腺癌、10 例鳞癌，早期（I、II 期）10 例、晚期（III、IV 期）11 例。芯片含 32,050 个特征，包括 30,968 个人类基因组探针和 1,082 个实验对照探针。数据可用于比较肿瘤与正常组织的基因表达差异，研究肺癌分子特征及分期、组织学亚型相关的表达变化（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：使用 Phalanx Human OneArray 芯片对 NSCLC 患者进行全基因组表达谱分析。手术切除的肿瘤组织及相应正常组织采集自 21 例在台湾台北荣民总医院就诊的原发性 NSCLC 患者。在本研究中，我们使用 cDNA 微阵列检测 21 例 NSCLC 患者肿瘤及相应正常样本的基因表达谱。其中 11 例为 AD 患者，10 例为 SQ 患者。患者包括 10 例早期患者（I 期和 II 期）和 11 例晚期患者（III 期和 IV 期）。杂交靶标由总 RNA 制备，并按照标准方案使用 Phalanx Human OneArray 芯片（共 32,050 个特征：30,968 个人类基因组探针和 1,082 个实验对照探针）进行杂交。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-21933
下载信息
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
采用Phalanx Human OneArray芯片对NSCLC患者进行全基因组表达谱分析。从台湾台北荣民总医院收治的21例确诊为原发性NSCLC的患者中，收集手术切除的肿瘤组织及相应正常组织。在本研究中，我们使用cDNA微阵列检测21例NSCLC患者肿瘤及相应正常样本中的基因表达谱。其中11例为AD患者，10例为SQ患者。患者包括10例早期患者（I期和II期）和11例晚期患者（III期和IV期）。杂交靶标由总RNA制备，并按照标准方案使用Phalanx Human OneArray芯片（共32,050个特征：30968个人类基因组探针和1082个实验对照探针）进行杂交。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
