缺氧非小细胞肺癌基因表达
缺氧促进癌症侵袭性生长导致化疗耐药，新策略靶向缺氧激活信号通路。为此建立离体模型，在保留肿瘤微环境和三维结构的非小细胞肺癌（NSCLC）片段中研究缺氧效应
基本信息
资源简介
缺氧非小细胞肺癌基因表达
缺氧促进癌症侵袭性生长导致化疗耐药，新策略靶向缺氧激活信号通路。肿瘤缺氧影响基质。为此建立离体模型，在保留肿瘤微环境和三维结构的非小细胞肺癌（NSCLC）片段中研究缺氧效应。NSCLC片段在缺氧或常氧下离体培养三天，对十例患者片段行cDNA微阵列分析。缺氧较常氧有107个基因显著调控且至少两倍变化；但腺癌和鳞癌中仅四个基因均显著调控，独立样本定量PCR验证（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：缺氧会触发侵袭性肿瘤生长，并导致化疗耐药。新型治疗策略旨在靶向缺氧激活的信号通路。肿瘤缺氧不仅影响肿瘤细胞，也影响周围的基质细胞。因此，建立了一种新的离体模型，可在保留肿瘤微环境和三维结构的非小细胞肺癌（NSCLC）片段中研究缺氧效应。微阵列分析鉴定出107个显著调控基因，与常氧片段相比，这些基因在缺氧片段中的表达变化至少为2倍。然而，在腺癌和鳞状细胞癌这两种亚型中，仅有4个基因受到显著调控。这4个基因的缺氧调控通过定量PCR在一个独立样本集中得到验证。将非小细胞肺癌（NSCLC）片段在缺氧或常氧条件下离体培养3天。对来自10例患者的缺氧和常氧肺癌片段进行了cDNA微阵列分析。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-30979
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-30979
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
缺氧会触发侵袭性肿瘤生长，并导致化疗耐药。新型治疗策略旨在靶向缺氧激活的信号通路。肿瘤缺氧不仅影响肿瘤细胞，也影响周围的基质细胞。因此，建立了一种新的离体模型，可在保留肿瘤微环境和三维结构的非小细胞肺癌（NSCLC）片段中研究缺氧效应。微阵列分析鉴定出107个显著调控基因，与常氧片段相比，这些基因在缺氧片段中的表达变化至少为2倍。然而，在腺癌和鳞状细胞癌这两种亚型中，仅有4个基因受到显著调控。这4个基因的缺氧调控通过定量PCR在一个独立样本集中得到验证。将非小细胞肺癌（NSCLC）片段在缺氧或常氧条件下离体培养3天。对来自10例患者的缺氧和常氧肺癌片段进行了cDNA微阵列分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
