基本信息

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创建/更新时间

2026-10-07

资源简介

人肺癌中转录因子DP1和CTNND1的基因扩增

本数据集来自omicsdi.org，聚焦人肺癌中转录因子DP1和CTNND1的基因扩增，属于肿瘤/肺癌与转录组学范畴。源站描述显示，研究为寻找肺癌中新的扩增基因，将69例人肺肿瘤的基因表达数据按转录本在人类基因组中的位置进行比对，寻找过表达基因簇，在13q34和11q12染色体区域发现四个肿瘤存在基因过表达，随后通过FISH分析证实这些扩增子存在高水平拷贝数，并对携带基因扩增的肿瘤进行SNP arrays分析，结果明确显示这些样本中存在高水平拷贝数扩增子，并测定了基因组拷贝数。该数据可用于肺癌相关基因扩增与过表达研究（来源 omicsdi.org）。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：寻找新的癌基因很重要，因为这些基因可能成为未来特异性抗癌治疗的靶点。在本研究中，我们报告了在肺癌中鉴定出新的扩增基因。为了找出肺癌中新的扩增基因，我们根据转录本在人类基因组中的位置比对了69例人肺肿瘤的基因表达数据，并寻找过表达基因簇。我们在染色体13q34和11q12中发现了一个基因过表达簇，这些肿瘤中有四个存在基因过表达。随后，我们在这些扩增子中进行了FISH分析，清楚地证明了这些染色体区域存在高水平拷贝数。我们对携带基因扩增的肿瘤进行了基于SNP arrays的分析。结果清楚地证明了这些样本中存在高水平拷贝数扩增子。我们测定了基因组拷贝数

【主题与分类】

主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-21168

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-21168

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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-21168

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- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

寻找新的致癌基因非常重要，因为这些基因可能成为未来特异性抗癌治疗的靶点。在本研究中，我们报告了在肺癌中识别出的新的扩增基因。为了发现肺癌中的新扩增基因，我们根据转录本在人类基因组中的位置，对69例人类肺部肿瘤的基因表达数据进行了比对，并搜寻过表达基因的集群。我们在13q34和11q12染色体上发现了一个基因过表达的集群，这一现象在四例肿瘤中出现。随后，我们对这些扩增子进行了FISH分析，结果清晰地显示了这些染色体区域存在高水平的拷贝数增加。我们采用基于SNP阵列的方法对携带基因扩增的肿瘤进行了研究。结果明确证实了这些样本中存在高水平的拷贝数扩增子。我们利用SNP阵列——Illumina Infinium HumanOmni1-Quad BeadChip，确定了四例鳞状细胞癌（SCC）肿瘤的基因组拷贝数概况。