肺类癌中染色质重塑基因的频繁突变

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001000650

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺类癌是罕见的肺部神经内分泌肿瘤。迄今为止，尚未对这些肿瘤发病机制背后的分子改变进行系统性研究。在此，我们对肺类癌进行了基因拷贝数分析（n=54）、基因组/外显子组（n=44）和转录组（n=69）测序，并观察到染色质重塑基因的频繁突变。共价组蛋白修饰因子和SWI/SNF复合物亚基分别在40%和22.2%的病例中发生突变，其中MEN1、PSIP1和ARID1A反复受累。与小细胞肺癌和大细胞神经内分泌肿瘤相比，TP53和RB1突变是罕见事件，提示肺类癌并非高度侵袭性肺神经内分泌肿瘤的早期祖病变，而是通过独立的细胞机制产生。这些数据还提示，染色质重塑基因的失活足以驱动肺类癌的转化。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。