FOXD3是肺癌中的新型抑癌因子

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-64513

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

转录因子叉头框D3（FoxD3）是属于叉头框（Fox）转录因子家族的一种转录因子。FOXD3在胚胎发生和神经嵴细胞发育中的功能已被明确界定。近年来，在多种癌症中发现了其抑癌功能。然而，关于其在肺癌发展中的作用研究仍然缺乏。我们的研究发现，肺癌中FoxD3的缺失增强了细胞生长和细胞侵袭。RNA测序分析表明，FoxD3的缺失主要影响细胞周期进程相关基因的表达。敲低FoxD3导致G2-M期细胞积累，并上调DNA复制许可因子MCM5和MCM4以及细胞周期调节因子polo样激酶-1（PLK1）和CDC6。这些基因在肺癌中的过表达与肺癌患者的不良临床预后相关。我们还发现，FoxD3沉默后高迁移率族蛋白B1（HMGB1）、Hras和Ephrin B1基因表达增加，这些基因可能参与增强肺癌细胞侵袭。

我们的研究揭示了FoxD3在肺癌中的抑癌功能，并首次全面分析了FoxD3调控的与肺癌细胞增殖和侵袭相关的基因。通过我们的分析所鉴定的受FoxD3调控的基因，将为揭示FoxD3抑癌功能的机制提供宝贵信息。我们对三个对照组和三个FOXD3敲低的A549细胞系进行了RNA测序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。