RBP2敲低后H1299细胞的表达数据
数据为在人肺癌细胞系 H1299 中敲低视网膜母细胞瘤结合蛋白-2（RBP2）后获得的基因表达微阵列分析结果，包含对照组与 RBP2 缺失组，使用一条 scramble shRNA 和两条针对人 RBP2 基因的 shRNA（RBP2 KD1、RBP2 KD2），每组两个重复
基本信息
资源简介
RBP2敲低后H1299细胞的表达数据
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肺癌分类，主题为 Transcriptomics。数据为在人肺癌细胞系 H1299 中敲低视网膜母细胞瘤结合蛋白-2（RBP2）后获得的基因表达微阵列分析结果，包含对照组与 RBP2 缺失组，使用一条 scramble shRNA 和两条针对人 RBP2 基因的 shRNA（RBP2 KD1、RBP2 KD2），每组两个重复。H1299 细胞感染携带 shRNA 的慢病毒 3 天，RNA 经 Trizol 试剂分离并用 bioanalyzer 分析，微阵列实验由 Academia Sinica 的 Affymetrix Gene Expression Service Laborator。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为鉴定受 RBP2 影响的基因，我们在对照和 RBP2 缺失的人肺癌细胞系中进行了基因表达微阵列分析。使用两条单独的 shRNA（RBP2 KD1 和 RBP2 KD2）以限制潜在的脱靶效应。使用一条 scramble 短发夹 RNA（shRNA）和两条针对人 RBP2 基因的单独 shRNA（RBP2 KD1 和 RBP2 KD2）。每组使用两个重复。H1299 细胞感染携带 shRNA 的慢病毒 3 天。RNA 通过 Trizol 试剂分离并用 bioanalyzer 分析。微阵列实验由 Academia Sinica 的 Affymetrix Gene Expression Service Laboratory 完成。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-41443
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-41443
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为鉴定受RBP2影响的基因，我们在对照和RBP2敲低的人肺癌细胞系中进行了基因表达微阵列分析。使用两种独立的shRNA（RBP2 KD1和RBP2 KD2）以限制潜在的脱靶效应。使用了一个乱序短发夹RNA（shRNA）和两个针对人RBP2基因的独立shRNA（RBP2 KD1和RBP2 KD2）。每组使用两个重复样本。H1299细胞被携带shRNA的慢病毒感染3天。使用Trizol试剂分离RNA，并通过生物分析仪进行分析。微阵列实验由中央研究院的Affymetrix基因表达服务中心实验室完成。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
