小鼠正常肺成纤维细胞与癌相关成纤维细胞的表达数据

数据为小鼠正常肺成纤维细胞(NFs)与小鼠肺癌相关成纤维细胞(CAFs)的基因表达微阵列结果,样本在体外培养后提取 RNA 并杂交于 mouse 430_2 Affymetrix 微阵列

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Expression data from (mouse) normal lung fibroblasts and carcinoma-associated fibroblasts

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

小鼠正常肺成纤维细胞与癌相关成纤维细胞的表达数据

该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题为 Transcriptomics。数据为小鼠正常肺成纤维细胞(NFs)与小鼠肺癌相关成纤维细胞(CAFs)的基因表达微阵列结果,样本在体外培养后提取 RNA 并杂交于 mouse 430_2 Affymetrix 微阵列。研究通过比较 NFs 与 CAFs 的转录组变化,寻找差异表达的分泌蛋白,以探讨 CAFs 在非小细胞肺癌进展中的作用。该数据可用于分析成纤维细胞在肿瘤微环境中的表达差异及相关功能机制(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):据报道,癌相关成纤维细胞(CAFs)通过多种机制支持肿瘤进展。然而,它们在非小细胞肺癌(NSCLC)进展中的作用仍不明确。此外,CAFs 分泌的特定蛋白质在多大程度上直接促进肿瘤生长也不清楚。为了研究 CAFs 在 NSCLC 中的作用,对小鼠和人肺 CAFs 进行了跨物种功能表征,包括比较正常小鼠肺成纤维细胞(NFs)和小鼠肺 CAFs 的基因表达分析,以寻找差异表达的分泌蛋白。使用基因表达微阵列来鉴定 NFs 和 CAFs 之间可能促成其不同促肿瘤能力的转录组变化。NFs 和 CAFs 在体外培养以提取 RNA,并在 mouse 430_2 Affymetrix 微阵列上杂交。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-48397

下载信息

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

已有报道称,癌相关成纤维细胞(CAFs)通过多种机制支持肿瘤进展。然而,其在非小细胞肺癌(NSCLC)进展中的作用仍不明确。此外,CAFs分泌的特定蛋白质在多大程度上直接促进肿瘤生长尚不清楚。为研究CAFs在NSCLC中的作用,对小鼠和人肺CAFs进行了跨物种功能表征,包括比较正常小鼠肺成纤维细胞(NFs)与小鼠肺CAFs的基因表达分析,以寻找差异表达的分泌蛋白。采用基因表达微阵列技术识别NFs与CAFs之间可能与其不同促瘤能力相关的转录组变化。将NFs和CAFs在体外培养,用于RNA提取并在小鼠430_2 Affymetrix微阵列上杂交。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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