CL1-0与CL1-5肺癌细胞系表达数据

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-42407

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为研究侵袭性转化，我们建立了一个肺癌细胞模型，从人肺腺癌亲本细胞系CL1中筛选出逐步侵袭的细胞群体。利用transwell小室筛选出五个渐进亚克隆，即CL1-1、CL1-2、CL1-3、CL1-4和CL1-5，它们显示出逐渐增强的侵袭潜能(Chu et al, 1997)。在此，我们采用微阵列技术分析并比较CL1-0与CL1-5之间的基因表达谱，以识别与侵袭/转移相关的基因特征。我们使用CL1-0和CL1-5肺癌细胞系提取RNA，并在Affymetrix微阵列上进行杂交。微阵列分析共使用了6张芯片，包括来自CL1-0的三个生物学重复和来自CL1-5的三个生物学重复。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。