CL1-0 肺癌细胞系 AK4 过表达与 CL1-5 肺癌细胞系 AK4 敲低的表达数据
该数据集来源于 omicsdi.org，属于肿瘤/肺癌分类下的转录组学数据。数据基于 Affymetrix 微阵列，对 AK4 过表达的 CL1-0 肺腺癌细胞和 AK4 敲低的 CL1-5 肺癌细胞进行 RNA 提取与杂交，用于分析 AK4 调控的基因表达
基本信息
资源简介
CL1-0 肺癌细胞系 AK4 过表达与 CL1-5 肺癌细胞系 AK4 敲低的表达数据
该数据集聚焦于肺癌侵袭转移机制中的分子调控研究，来源于 omicsdi.org，归类于肿瘤/肺癌方向，属于转录组学数据。数据集基于 Affymetrix 微阵列平台，对 AK4 过表达的 CL1-0 肺腺癌细胞以及 AK4 敲低的 CL1-5 肺癌细胞进行 RNA 提取与杂交，旨在分析 AK4 调控的基因表达谱，从而揭示其在侵袭-转移级联过程中的作用。整体来看，该数据集为研究 AK4 在肺癌细胞迁移、侵袭及转移中的功能提供了转录水平的表达信息，适用于肿瘤生物学、肺癌转移机制以及基因表达调控等相关领域的分析工作。
【数据集背景】
该数据集围绕 AK4 在肺癌中的功能展开。源站描述指出，研究已证明 AK4 下调 shRNA 可显著降低高侵袭性肺癌细胞系在体外的细胞迁移和侵袭能力，同时在体内也降低肺转移。为了进一步分析 AK4 调控的、与侵袭-转移级联相关的基因表达变化，研究者选用了 CL1-0 肺腺癌细胞进行 AK4 过表达，并选用 CL1-5 细胞进行 AK4 敲低，随后开展微阵列分析。这一背景表明，该数据集的核心科学问题在于阐明 AK4 表达变化如何影响肺癌细胞的基因表达程序，进而影响侵袭和转移表型。
【数据内容】
该数据集属于转录组学数据，基于 Affymetrix 微阵列产生。具体而言，研究对 AK4 过表达的 CL1-0 肺腺癌细胞和 AK4 敲低的 CL1-5 肺癌细胞进行了 RNA 提取与杂交。数据内容反映的是这两种细胞模型在 AK4 表达水平改变后的基因表达谱。数据集英文名称为“Expression data from AK4 overexpression in CL1-0 lung cancer cell line and AK4 knockdown in CL1-5 lung cancer cell line”，直接点明了所涉及的细胞系、基因操作方式以及数据类型。主题标签为 Transcriptomics，进一步说明其组学层面属于转录组范畴。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述，实验流程包括：选择 AK4 过表达的 CL1-0 肺腺癌细胞和 AK4 敲低的 CL1-5 细胞，进行 RNA 提取，并在 Affymetrix 微阵列上进行杂交。源站描述还提到，研究使用微阵列来分析 AK4 调控的、构成侵袭-转移级联基础的基因表达。除上述信息外，关于样本采集时间、地点、伦理审批、具体芯片型号、重复数量等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肺癌转移机制研究，尤其是围绕 AK4 基因功能展开的转录组分析。潜在应用包括：比较 AK4 过表达与敲低条件下基因表达差异，识别受 AK4 调控的候选基因或通路，探索与细胞迁移、侵袭和肺转移相关的分子标志物。此外，该数据集也可用于转录组学方法学参考，例如基于 Affymetrix 微阵列的肺癌细胞系表达谱分析。由于涉及 CL1-0 和 CL1-5 两种肺腺癌细胞模型，该数据适合用于体外细胞水平的功能基因组学研究，并可为后续体内转移实验提供表达层面的线索。具体分析场景需结合源站提供的原始数据与元信息进行判断。
【使用方法】
使用该数据集时，可围绕 AK4 过表达与敲低两种条件进行分组比较，分析差异表达基因及其富集的生物学过程。由于数据基于 Affymetrix 微阵列，通常需要经过背景校正、归一化、探针注释和差异表达统计等步骤。研究者可将表达谱与侵袭、转移表型关联，筛选 AK4 下游候选靶点。若需整合其他转录组数据，应注意平台差异和批次效应。关于原始数据下载地址、预处理参数、分析工具推荐等，源站未提供，需依据数据实际获取渠道进一步确认。
【质量与限制】
该数据集基于 Affymetrix 微阵列，属于较早的高通量表达检测技术，其动态范围和灵敏度可能受平台特性限制。源站描述中未提供样本量、重复数、统计功效、验证实验细节等信息，因此无法对数据质量进行完整评估。此外，该数据仅涉及 CL1-0 和 CL1-5 两种肺癌细胞系，结论外推到其他细胞系或临床样本时需谨慎。关于数据是否存在批次效应、是否经过标准化处理、是否有原始图像文件等，源站未提供。使用时应结合源站提供的原始记录和质控信息进行判断。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制以及原始文献信息，源站未提供。使用者应在获取数据时查阅 omicsdi.org 对应条目或原始数据仓库的相关说明，以确认引用要求和许可条件。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-37903
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们证明，AK4下调shRNA在体外显著降低了高侵袭性肺癌细胞系的细胞迁移和侵袭能力，在体内也显著减少了肺转移。我们使用微阵列技术分析了AK4调控的、作为侵袭-转移级联基础的基因表达。选择过表达AK4的CL1-0肺腺癌细胞和敲低AK4的CL1-5细胞进行RNA提取，并在Affymetrix微阵列上进行杂交。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
