基于循环microRNA谱检测肺部肿瘤
该数据集来自omicsdi.org,旨在探究循环microRNA作为生物标志物能否提升肺癌检测效果。研究采集了超过3000名个体的血液样本,使用PAXgene采血管,个体涵盖肺癌、非肿瘤性肺病、其他疾病及健康对照四类

基本信息
资源简介
基于循环microRNA谱检测肺部肿瘤
该数据集来自omicsdi.org,旨在探究循环microRNA作为生物标志物能否提升肺癌检测效果。研究采集了超过3000名个体的血液样本,使用PAXgene采血管,个体涵盖肺癌、非肿瘤性肺病、其他疾病及健康对照四类。对每位个体测定其miRNA表达模式,总RNA经Qiagen PAXgene Blood miRNA Kit提取,并用Agilent miRNA Complete Labeling and Hyb Kit标记杂交,通过Agilent微阵列扫描系统扫描。数据可用于基于miRNA表达谱的肺癌分类与生物标志物研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们旨在确定循环miRNA作为生物标志物能否改善肺癌检测。为此,我们使用PAXgene采血管采集了超过3000名个体的血液。这些个体被诊断为肺癌(LCa)、非肿瘤性肺病(NTLD)、其他疾病(OD)或为健康对照。对每位个体,我们测定了其miRNA表达模式。总RNA用Qiagen PAXgene Blood miRNA Kit提取,用Agilent miRNA Complete Labeling and Hyb Kit标记并杂交,并用Agilent微阵列扫描系统扫描。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-8026
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-8026
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们旨在探究循环miRNA作为生物标志物是否能提高肺癌检测效果。为此,我们使用PAXgene采血管收集了3000多人的血液样本。这些个体被诊断为肺癌、非肿瘤性肺部疾病、其他疾病或作为健康对照。我们为每位个体确定了其miRNA表达模式。总RNA采用Qiagen PAXgene血液miRNA试剂盒提取,随后使用Agilent miRNA完整标记与杂交试剂盒进行标记和杂交,并通过Agilent微阵列扫描系统进行扫描。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




