深度多区域全基因组测序揭示初治转移性肺癌的异质性和基因-环境相互作用
基于深度多区域全基因组测序的初治转移性肺癌研究数据,分析肿瘤异质性、突变特征及基因-环境交互。

基本信息
资源简介
深度多区域全基因组测序揭示初治转移性肺癌的异质性和基因-环境相互作用
【一句话概览】
该数据集编号为EGAS00001003830,原始描述为深度多区域全基因组测序,揭示未经治疗、转移性肺癌中的异质性与基因-环境相互作用,来源为OmicsDI;受试者数为20(来源 OmicsDI)。
【数据内容】
源站原始描述:EGAS00001003830 - Deep multi-region whole-genome sequencing reveals heterogeneity and gene-by-environment interactions in treatment-naive, metastatic lung cancer - OmicsDI
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):EGAS00001003830 - 深度多区域全基因组测序揭示初治转移性肺癌中的异质性与基因-环境相互作用 - OmicsDI
【适用方向】
组学数据适用于生物标志物发现与分子分型相关建模研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001003830
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001003830
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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