循环肿瘤细胞高特异性鉴定用于PD-L1准确评估的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.q8150

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数据集大小约 288.6 MB。

数据说明

背景：非小细胞肺癌（NSCLC）中程序性死亡配体1（PD-L1）的表达通常通过侵入性活检来评估；然而，循环肿瘤细胞（CTC）鉴定方面的最新进展可能为检测肿瘤细胞提供一种侵入性较小的方法。这些液体活检依赖于从血液中多样化的细胞群体中准确识别CTC，其中一些肿瘤细胞与正常血细胞具有共同特征。虽然许多血细胞可以通过其高表达CD45而被排除，但中性粒细胞和其他未成熟髓系亚群CD45表达低或缺失，并且也表达PD-L1。此外，细胞角蛋白通常用于识别CTC，但中性粒细胞可能对细胞内抗体（包括细胞角蛋白）发生非特异性染色，从而妨碍对肿瘤细胞上PD-L1表达的准确评估。在评估上皮细胞黏附分子（EpCAM）阳性和EpCAM阴性CTC（如在上皮-间质转化（EMT）中）的PD-L1时，这一点更为重要。方法：为评估CTC错误识别对PD-L1评估的影响，我们使用CD11b来识别髓系细胞。

从转移性NSCLC患者中使用EpCAM、MUC1或波形蛋白捕获抗体以及基于排除的样本制备（ESP）技术分离了循环肿瘤细胞（CTCs）。结果：在血沉棕黄层中鉴定出大量CD11b+CD45lo细胞，并且这些细胞对包括细胞角蛋白在内的细胞内抗体呈非特异性染色。被错误鉴定为CTCs的CD11b+细胞数量因患者而异；占传统鉴定CTCs的33-100%。用波形蛋白捕获的细胞中CD11b+细胞频率更高，为41%，而用MUC1或EpCAM捕获的分别为20%和18%。被错误鉴定为CTCs的细胞最终使PD-L1表达在不同患者样本中出现了不同程度的偏移。结论：通过额外的染色标准，可以将干扰性髓系细胞群体与真正的CTCs区分开来。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。