靶向质谱方法在活性蛋白质组学分析中的比较 2：DIA
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肺癌分类，用于比较活性蛋白质组学分析（ABPP）中不同靶向质谱方法。研究使用 H1993 肺癌细胞，先以 DMSO、dasatinib 或 erlotinib 预处理细胞裂解物，再加入 ATP 探针进行 ABPP，比较不同激酶抑制剂的激酶标记差异；随后
基本信息
资源简介
靶向质谱方法在活性蛋白质组学分析中的比较 2：DIA
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肺癌分类，用于比较活性蛋白质组学分析（ABPP）中不同靶向质谱方法。研究使用 H1993 肺癌细胞，先以 DMSO、dasatinib 或 erlotinib 预处理细胞裂解物，再加入 ATP 探针进行 ABPP，比较不同激酶抑制剂的激酶标记差异；随后用 vehicle 对照、BEX-235（PI3K 抑制剂）或 Crizotinib 处理细胞以考察细胞信号变化。采用 DDA、DIA（pSMART）、PRM 和 SRM/MRM 进行 LC-MS/MS 检测并相对定量 desthiobiotinylated 激酶肽段（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：为了考察在通过脱硫生物素化探针富集后进行活性蛋白质组学分析（ABPP）时监测激酶的不同质谱方法，使用 H1993 肺癌细胞进行了两项实验。首先，在加入用于 ABPP 的 ATP 探针之前，用 DMSO 溶剂、dasatinib 或 erlotinib 预处理细胞裂解物，以比较与靶标选择性不同的激酶抑制剂示例相关的激酶标记差异。然后，为了考察细胞信号变化，用溶剂对照、BEX-235（PI3K 抑制剂）或 Crizotinib 处理 H1993 细胞。使用数据依赖采集、数据非依赖采集（pSMART）、平行反应监测和选择反应监测（或多反应监测）质谱的 LC-MS/MS 来检测并相对定量脱硫生物素化激酶肽段。
【主题与分类】
主题标签：Dda、Activity-based protein profiling、Dia、Prm、Srm/mrm、Lung cancer。本站分类：肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD006096
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD006096
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
为考察基于活性的蛋白质谱分析（ABPP）中，经脱硫生物素化探针富集后监测激酶的不同质谱方法，用H1993肺癌细胞进行了两项实验。首先，在加入用于ABPP的ATP探针之前，用DMSO溶媒、达沙替尼或厄洛替尼预处理细胞裂解液，以比较与靶标选择性不同的激酶抑制剂示例相关的激酶标记差异。随后，为考察细胞信号传导的变化，用溶媒对照、BEX-235（PI3K抑制剂）或克唑替尼处理H1993细胞。采用数据依赖型采集、数据非依赖型采集（pSMART）、平行反应监测和选择反应监测（或多反应监测）质谱的LC-MS/MS来检测并相对定量脱硫生物素化激酶肽。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
