肺癌蛋白质组图谱比较4:DDA

项目旨在利用肺鳞状细胞癌及癌旁肺组织,比较无标记定量、串联质量标签化学标记和数据非依赖采集发现蛋白质组学方法。本数据集补充了采用数据依赖采集的单样本LC-MS/MS分析,以便与PRIDE数据集“Comparison of Lung Cancer Proteome Profiles 3: DIA”进行

omicsdi
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蛋白质分类Data dependent acquisitionLung cancerDiscovery proteomicsLc-ms/msSingle sample analysis
Comparison of Lung Cancer Proteome Profiles 4: DDA

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

肺癌蛋白质组图谱比较4:DDA

本数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,英文名为Comparison of Lung Cancer Proteome Profiles 4: DDA。项目旨在利用肺鳞状细胞癌及癌旁肺组织,比较无标记定量、串联质量标签化学标记和数据非依赖采集发现蛋白质组学方法。本数据集补充了采用数据依赖采集的单样本LC-MS/MS分析,以便与PRIDE数据集“Comparison of Lung Cancer Proteome Profiles 3: DIA”进行直接比较,后者使用数据非依赖采集对单样本进行LC-MS/MS分析。数据可用于肺癌蛋白质组学方法学比较研究(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本项目的目标是比较无标记定量、串联质量标签化学标记和数据非依赖采集发现蛋白质组学方法,使用肺鳞状细胞癌和癌旁肺组织。这项额外的采用数据依赖采集的单样本LC-MS/MS分析,旨在能够与PRIDE数据集进行直接比较,该数据集标题为“Comparison of Lung Cancer Proteome Profiles 3: DIA”,其中单样本使用数据非依赖采集通过LC-MS/MS进行分析。

【主题与分类】

主题标签:Data dependent acquisition、Lung cancer、Discovery proteomics、Lc-ms/ms、Single sample analysis。本站分类:肿瘤/肺癌。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD005733

下载信息

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源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD005733

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目的目标是通过肺鳞状细胞癌及邻近肺组织,比较非标记定量、串联质量标签化学标记以及数据独立采集发现蛋白质组学方法。此额外的单样本LC-MS/MS分析采用数据依赖型采集进行,旨在能够直接与PRIDE数据集“肺癌蛋白质组图谱比较3:DIA”进行对比,其中单样本通过LC-MS/MS使用数据独立采集进行分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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