原发性小细胞肺癌小鼠克隆细胞系的阵列比较基因组杂交

该数据集来源于 omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题标签为 Transcriptomics。数据内容为对源自原发性小鼠小细胞肺癌肿瘤的克隆细胞系进行阵列比较基因组杂交分析,以识别其中的共同区域

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Comparative genomic hybridization by array of mouse clonal cell lines derived from primary small cell lung cancer tumors

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

原发性小细胞肺癌小鼠克隆细胞系的阵列比较基因组杂交

该数据集为一项针对小鼠小细胞肺癌的阵列比较基因组杂交研究,英文名称为 Comparative genomic hybridization by array of mouse clonal cell lines derived from primary small cell lung cancer tumors。其来源站为 omicsdi.org,在分类上归属于肿瘤 / 肺癌方向,主题标签为 Transcriptomics。数据集的核心内容是对源自原发性小鼠小细胞肺癌肿瘤的克隆细胞系进行阵列比较基因组杂交分析,目的在于识别这些克隆细胞系中的共同区域。整体而言,该数据集围绕小鼠小细胞肺癌模型展开,通过克隆细胞系与比较基因组杂交技术相结合,为观察肿瘤基因组层面的共性变化提供了数据基础,适用于肿瘤生物学、肺癌研究以及相关转录组学背景下的探索性分析。

【数据集背景】

小细胞肺癌是一种具有高度侵袭性的肺部恶性肿瘤,针对其发生发展机制的研究常需要借助动物模型与细胞模型。该数据集所涉及的克隆细胞系来源于原发性小鼠小细胞肺癌肿瘤,这一来源设定使其与原发性肿瘤之间存在直接对应关系,有助于在可控的细胞体系内研究肿瘤相关基因组特征。比较基因组杂交是一种用于检测基因组拷贝数变化的技术,将其与阵列平台结合,可以在较高通量下分析多个样本的基因组改变。该数据集正是在这一研究框架下产生,旨在通过阵列比较基因组杂交手段,对源自原发性小鼠小细胞肺癌肿瘤的克隆细胞系进行比较分析,从而识别其中的共同区域。该数据集在分类上属于肿瘤 / 肺癌,主题标签为 Transcriptomics,说明其与转录组学主题存在关联,但具体关联方式源站未提供。

【数据内容】

数据集的内容为对源自原发性小鼠小细胞肺癌肿瘤的克隆细胞系进行阵列比较基因组杂交分析。根据源站描述,这些克隆细胞系被用于比较基因组杂交,以识别其中的共同区域。由此可知,数据集的核心对象是小鼠小细胞肺癌来源的克隆细胞系,核心实验类型为阵列比较基因组杂交,核心分析目标为发现共同区域。关于样本数量、细胞系具体数目、杂交平台型号、探针信息、数据文件格式、数据规模、原始数据与处理后数据的具体构成等,源站未提供。关于所识别出的共同区域的具体位置、数量、涉及基因或基因组区间,源站未提供。关于是否包含转录组表达数据、是否包含临床信息或样本表型信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。其英文名称表明数据与小鼠小细胞肺癌来源的克隆细胞系相关,且采用阵列比较基因组杂交方法。源站描述进一步说明,这些克隆细胞系源自原发性小鼠小细胞肺癌肿瘤,并被用于比较基因组杂交以识别共同区域。除来源站与上述描述外,关于样本采集的具体地点、时间、机构、伦理审批信息、动物品系、肿瘤诱导方式、细胞系建立方法、实验操作流程、试剂与仪器信息等,源站未提供。关于数据提交者、提交时间、版本历史或更新记录,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤 / 肺癌相关研究,尤其是围绕小鼠小细胞肺癌模型开展的基因组层面探索。由于主题标签为 Transcriptomics,其可能被用于与转录组学相关的交叉分析场景,但具体适用方式需结合数据实际内容判断,源站未提供进一步说明。潜在使用方向包括:识别小鼠小细胞肺癌克隆细胞系中的共同基因组区域,比较不同克隆细胞系之间的基因组改变模式,以及将阵列比较基因组杂交结果作为后续研究的候选区域来源。该数据集也可用于方法学参考,例如在肿瘤细胞系模型中应用阵列比较基因组杂交识别共同区域的研究设计。关于该数据集是否适用于临床转化研究、药物响应预测或生物标志物验证,源站未提供相关信息。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取或检索。使用时应依据其英文名称与源站描述,明确其研究对象为源自原发性小鼠小细胞肺癌肿瘤的克隆细胞系,实验类型为阵列比较基因组杂交,分析目标为识别共同区域。由于源站未提供具体的数据格式、下载方式、访问权限、是否需要注册、是否提供 API 或批量下载途径,使用前需在来源站进一步确认。关于数据处理流程、归一化方法、质量控制标准、分析软件或参考基因组版本,源站未提供。若需将本数据集与转录组学数据联合使用,应自行确认数据兼容性与可比性,源站未提供相关指导。

【质量与限制】

该数据集基于克隆细胞系与阵列比较基因组杂交技术,其优势在于能够在细胞模型层面分析基因组改变并识别共同区域。然而,关于样本量、重复次数、实验批次、平台分辨率、数据完整性、缺失值比例、质控通过率等关键质量指标,源站未提供。关于克隆细胞系在传代过程中可能产生的基因组漂移、克隆选择偏倚或与原发肿瘤的差异程度,源站未提供。关于共同区域的统计显著性、阈值设定或验证实验信息,源站未提供。因此,使用该数据集时需注意其信息覆盖范围有限,不宜在缺乏补充信息的情况下对其质量或结论强度作出判断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、DOI、作者列表、贡献者信息以及许可协议类型,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应前往来源站 omicsdi.org 查询相关条目,以获取准确的引用要求与许可条款。关于是否允许商业使用、是否允许再分发、是否要求署名或共享方式,源站未提供。

下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-NCMF-36

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Clonal cell lines derived from primary murine Small Cell Lung Cancer tumors where analyzed by Comperative genomic hybridisation to identify common regions.

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