Claudin 1介导TNF alpha诱导的人肺癌细胞基因表达与细胞迁移

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-32254

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数据说明

上皮-间质转化（EMT）是癌变过程中的一个重要机制。确定参与调控EMT的机制对于开发针对癌症的新生物标志物和治疗靶点至关重要。在本研究中，当使用TGFβ1和TNFα诱导人肺癌A549细胞发生EMT时，我们惊讶地发现上皮细胞紧密连接标志物Claudin 1增加。我们进一步确定，是TNFα而非TGFβ1诱导了成纤维细胞样形态变化。TNFα还导致Triton X-100可溶性胞质组分中Claudin-1基因表达和蛋白水平升高。使用小干扰RNA（siRNA）下调Claudin-1，抑制了75%由TNFα诱导的基因表达变化。Claudin-1 siRNA有效阻断了TNFα诱导的与炎症和细胞运动相关的分子功能网络。伤口愈合实验表明，Claudin-1 siRNA能够显著减少TNF增强的细胞迁移。此外，使用Claudin 1-pcDNA3.1/V5-His载体过表达Claudin 1增强了细胞迁移。

总之，这些观察结果表明，Claudin 1在TNFα诱导的人肺癌细胞基因表达和细胞迁移中起着关键的信号介质作用。对这些细胞过程的进一步分析可能有助于开发新的治疗策略。4组（有或无TNFα，对照或Claudin 1 siRNA）人肺腺癌A549细胞，每组3个重复。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。