肺癌细胞系 A549 (A) 和 HTB56 (H) 全局基因表达变化 [Affymetrix 微阵列]

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-52143

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在此，我们利用Affymetrix微阵列平台分析了与非小细胞肺癌促转移表型相关的全球基因表达变化。我们通过Affymetrix微阵列在肺癌细胞系A549（A）和HTB56（H）中确定了全球基因表达的变化。我们生成了在静脉注射后在小鼠肺部形成肿瘤结节倾向显著增加的NSCLC细胞系。除了正常细胞系（0R）外，我们还分析了经过三轮体内筛选以趋向高度转移表型的细胞系（3R）的基因表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。